含氯復合肥是指肥料中含有氯離子的一類化肥，如氯化鉀、氯化銨、農鹽等。使用含氯化肥時氯離子容易隨肥料而帶到土壤中，使土壤中鹽濃度提高，引起作物的氯害，甚至出現燒種燒苗。因此按照以下五個方法來施肥，一定會取得很好的效果的。
一、根據作物不同的耐氯性慎施。根據作物對氯的忍耐能力把作物分為3類：一是強耐氯作物，如水稻、棉花、大麥、高粱等；蔬菜中的菠菜、南瓜、菜豆；果樹中的獼猴桃、山楂、桃樹、香蕉；二是耐氯作物，如玉米、小麥、花生、大豆、油菜；三是耐氯差的作物，如紅薯、馬鈴薯、西瓜、煙草、茶樹及蔬菜中的萵苣等。含氯肥料應首先施用在強耐氯作物上，其次施用在耐氯作物上，耐氯差的作物不施，以免產生氯害，降低產量和影響品質。
二、選擇適宜施用的土壤。含氯化肥宜施用在pH值＞6.5、含鈣較豐富的中性或鈣質土壤上。若在酸性土壤中施用，宜先配施石灰或其他堿性肥料，施后土壤混勻，再覆蓋深施含氯化肥。在多雨地區或多雨季節，施用含氯化肥，氯離子可隨水流失，不易被土壤吸附積累而引起作物氯害，在降雨量大的地區及水稻產區，適合施用含氯化肥。在鹽堿地土壤中，因氯離子含量較高，應禁用含氯化肥。
三、作混配肥施用。合理地將氮、磷鉀肥料混配施用，既可發揮養分間的交互效應，又可改善混合前單一肥料的某些不良性質。實踐表明，氯化鉀、氯化銨與尿素、磷酸銨、普鈣制成二元或三元復混肥施用，可緩解氯離子危害以及吸濕結塊的不良特性，而且氮、磷、鉀配合施用，可以起到相得益彰的作用。
四、掌握施用方法及用量。含氯化肥可作基肥或追肥，但根據氯離子的水溶性，不宜用作種肥或面層肥。氯離子遇水會生成水溶性氯化肥，提高水溶液濃度，對作物種子發芽及幼苗生長不利，故不宜與作物種子及幼苗直接接觸。作基肥宜施入土表以下4-6厘米，或條施在作物行間，以免接觸種子及幼苗根系。旱地作物追施可以采用撒施，施后及時中耕。含氯化肥的合適施用量以氯濃度小于200毫克/千克為好，折合畝施氯化鉀30-40千克，氯化銨20-40千克，氯化鉀復合肥40-50千克。
五、配合施用有機肥及磷肥。在施用含氯化肥的同時，配施有機肥，既可提高含氯化肥的肥效，又可減輕氯的不利影響。根據氯、磷離子的拮抗作用，結合適施磷肥，可以利用氯與磷離子的拮抗作用，降低氯的毒害，從而達到施用的目的。在酸性較強（pH值5以下）的土壤中，每隔1-2年適施1次鎂磷肥（石灰或草木灰亦可），更能發揮含氯化肥的肥效。但應注意，上述肥料不宜直接混施。