肥料是現在農業生產必不可少的，但是在肥料的使用中，肥料之間也有“相生相克”得矛盾。比如多施磷肥，多余的有效磷與土壤中的有效鋅結合形成難溶性的磷酸鋅沉淀，而引起土壤有效鋅的缺乏。不僅如此，多余的有效磷還會抑制作物對氮的吸收，引起氮的缺乏。又比如多施鉀肥，多余的鉀會減少作物對氮、鎂、鈣、硼和鋅的吸收，引起農作物體內缺乏這些營養元素。即使是有機肥也不可過多施用。如果施用過多，土壤中微生物與農作物會出現“爭氮”“奪氮”的矛盾，引起土壤一段時間內暫時缺氮，而且多余的有機質與鋅形成絡合物或螯合物，會降低鋅的有效性。要防止肥料之間“相克”，可采取以下方法：
盡可能做到平衡施肥目前仍有一些農戶對農作物偏施或多施單質肥料，不僅浪費了肥料，增加了生產成本，而且導致其他某種或某些營養元素的缺乏。施肥時要根據農作物需肥結構的不同和土壤的供肥能力，做到量出為入，不偏不少，力求營養元素之間的平衡，這樣就可以相安無事。另外，還要根據不同作物對各種營養元素的需求比例關系，要增同增，要減同減。相對單質肥料而言，復合肥或復混肥營養元素的比例關系比較適當和協調。因此，施肥時應以復合肥為主，以單質肥料為輔，如對于以塊莖、塊根為收獲對象的蔬菜等需鉀量大的農作物，可在施用硫基復合肥的基礎上，再適當增加硫酸鉀單質肥料作補充。
錯開施用時期或施用部位鋅肥和磷肥若混施必然會產生“相克”。因此磷肥應作底肥或基肥施用，鋅肥應作追肥施用。氮、磷、鉀等大量元素肥料應以根際追肥為主，微肥應采取葉面噴施的方法。縮小接觸范圍氮、鉀肥可采用撒施的方法，磷肥可采用集中施肥的方法，微肥可采用拌種、浸種、蘸根等方法，使微量元素局限在根部這一較小的范圍內，盡量不與大量元素接觸。