在真假復合肥的鑒別后，要更加優質的選著好，選著對復合肥，還要結合實際如：按肥料性質科學選用復合肥、按作物品種科學選用復合肥、按土壤性狀科學選用復合肥、按施肥方法科學選用復合肥這四項原則，就行選購。
一、按肥料性質科學選用復合肥
目前市場上銷售復合肥料有相當部分不符合國家DB15063-94標準。國家標準規定，復混肥(復合肥)有效養分含量，高濃度氮磷鉀總量≥40%，低濃度氮磷鉀含量≥25%，不包括微量元素和中量元素；水溶性磷含量≥40%，水分子含量低于5%；粒徑為1～4.75毫米等。所以選購復合肥時除了看商標和養分含量外，還需注意廠家和產地。此外，復合肥中的鉀有兩種，一種為氯化鉀，另一種為硫酸鉀。氯化鉀含有氯，對忌氯作物不宜施用。凡復合肥料袋上沒有標“S”符號者其鉀皆為氯化鉀，忌氯作物如葡萄、馬鈴薯、煙草、甜菜等千萬不能施用，一定要選用肥料袋上標有“S”符號的復合肥，即由硫酸鉀組成的復合肥。
二、按作物品種科學選用復合肥
一般大田作物選用氮磷鉀復合肥，小麥高產田應選用氮磷鉀三元復合肥；小麥、水稻、谷子等密植作物，適宜用粉狀復合肥；稀植中耕作物如玉米應選用顆粒狀復合肥；蔬菜尤其是果菜和根菜類及果樹等經濟作物需要較多，應選用含鉀較高、低氮的氮磷鉀復合肥。
三、按土壤性狀科學選用復合肥
對微堿性、有機質含量偏低(土壤ph值一般為8.0左右)、有效氮和磷缺乏的土壤，一般應選用酸性復合肥，如磷酸一銨或腐植酸類氮磷鉀復合肥、氮磷復合肥為宜。但對少數紅粘土或酸性棕壤土應選用堿性復合肥，如磷酸二銨等。
四、按施肥方法科學選用復合肥
為提高復合肥的肥效，不同施用方法應選不同劑型復合肥。作基肥施用時必須選用顆粒狀復合肥，而且顆粒的硬度愈高愈好，肥效長。選用復合肥中氮素由銨態氮配成的復合肥，有利提高氮素的利用率。如作追肥施用則應選用粉狀復合肥，而且要注意復合肥磷素中的水溶性磷含量應大于40%，氮素則由銨態氮和硝態氮兩種類型氮組成的復合肥為宜。一般基施腐植酸類復合肥的效果優于追施效果