萬物都是相生相克的，所以肥料在施用時要注意其克星，以免影響肥效。
肥料之間有“相生”關系，也有“相克”矛盾。比如多施磷肥，多余的有效磷與土壤中的有效鋅結合形成難溶性的磷酸鋅沉淀，而引起土壤有效鋅的缺乏。不僅如此，多余的有效磷還會抑制作物對氮的吸收，引起氮的缺乏。又比如多施鉀肥，多余的鉀會減少作物對氮、鎂、鈣、硼和鋅的吸收，引起農作物體內缺乏這些營養元素。即使是有機肥也不可過多施用。如果施用過多，土壤中微生物與農作物會出現“爭氮”“奪氮”的矛盾，引起土壤一段時間內暫時缺氮，而且多余的有機質與鋅形成絡合物或螯合物，會降低鋅的有效性。
要防止肥料之間“相克”，可采取以下方法：
盡可能做到平衡施肥。對農作物偏施或多施單質肥料，不僅浪費了肥料，增加了生產成本，而且導致其他某種或某些營養元素的缺乏。施肥時，要根據農作物需肥結構的不同和土壤的供肥能力，做到量出為入，不偏不少，力求營養元素之間的平衡，這樣就可以相安無事。
另外，還要根據不同作物對各種營養元素的需求比例關系，要增同增，要減同減。相對單質肥料而言，復合肥或復混肥營養元素的比例關系比較適當和協調。因此，施肥時應以復合肥為主，以單質肥料為輔，如對于以塊莖、塊根為收獲對象的蔬菜等需鉀量大的農作物，可在施用硫基復合肥的基礎上，再適當增加硫酸鉀單質肥料作補充。
縮小接觸范圍。氮、鉀肥可采用撒施的方法；磷肥可采用集中施肥的方法；微肥可采用拌種、浸種、蘸根等方法，使微量元素局限在根部這一較小的范圍內，盡量不與大量元素接觸。
錯開施用時期或施用部位。鋅肥和磷肥若混施，必然會產生“相克”。因此磷肥應作底肥或基肥施用，鋅肥應作追肥施用。氮、磷、鉀等大量元素肥料應以根際追肥為主，微肥應采取葉面噴施的方法。