肥料是重要的農業生產資料，農業的持續穩定發展離不開肥料。化肥因其養分含量豐富，增產效果顯著，在生產中被廣泛應用。隨著有機農業發展的加快，還有民眾對環境問題和土壤循環利用認知的逐步提高，生物有機肥料的需求也越來越大。
什么是生物有機肥？
生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體（如畜禽糞便、農作物秸稈等）為來源并經化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。生物有機肥對實現資源節約型、環境友好型社會具有重要意義，是實現農業可持續發展的必然選擇。
生物有機肥的優勢：
生物有機肥是在堆肥的基礎上，向腐熟物料中添加功能性微生物菌劑進行二次發酵而制成的含有大量功能性微生物的有機肥料。它與其他肥料相比具有培肥土壤、改善產品品質等優勢。
與化肥相比，生物有機肥的營養元素更為齊全，長期使用可有效改良土壤，調控土壤及根際微生態平衡，提高作物抗病蟲能力，提高產品質量。
與農家肥相比，生物有機肥的根本優勢在于：生物有機肥中的功能菌對提高土壤肥力、促進作物生長具有特定功效，而農家肥屬自然發酵生成，不具備優勢功能菌的。
與生物菌肥相比，生物有機肥包含功能菌和有機質，有機質除了能改良土壤，其本身就是功能菌生活的環境，施入土壤后功能菌容易定殖并發揮作用；而生物菌肥只含有功能菌，且其中的功能菌可能不適合有的土壤環境，無法存活或發揮作用。另一方面，生物有機肥比生物菌肥價格更為便宜。
生物有機肥的作用：
一、促進植物生長作用。
主要是通過功能菌在植物根部定植、生活并發揮作用。這種作用是通過功能菌產生促進植物生長的物質體現的，有別于在生物有機肥料中添加激素的作用。有些生產廠家為了讓農民看到效果，在產品中加入一定量的激素，這是不科學的，通過前幾期南農大講堂中設計的試驗方法可以辨別。
二、提高植物防病抗病能力，也就是生物防治作用。
這類菌種作用于病原菌的方式主要有三種：1.拮抗作用。產生拮抗物質直接抑制病原菌生長。2.競爭作用。從營養吸收利用等方面抑制病原菌生長，一般情況下這種菌種生長速度很快。3.寄生作用。以病原菌為寄生，直接寄生在病原菌身上導致病原死亡。這三種抗病防病作用方式常常是交叉的。
三、提高肥料利用率。
在目前生物有機肥料市場中被宣傳得較多，主要有固氮、解鉀、活磷等作用。固氮作用主要有三類：1.共生固氮。以根瘤菌為主，菌種寄主有專一性，固氮能力很強，主要在豆科植物上共生固氮。但是由于這一類菌種均為革蘭氏陰性細菌，不利于保存，作為產品進行貨架銷售比較困難，所以一般是拿到菌種即拌種使用。2.自生固氮作用。菌種在田間表現為不固氮或固氮能力很小。3.聯合固氮。菌種相對專一，能力較強，但目前研究和推廣應用的比較少，因此，須謹防產品包裝上夸大固氮能力。
四、保水抗旱、土壤修復、降解農藥等功能。
對這類生物有機肥料的功能宣傳比較少，主要因為經銷商和農民對這方面功能的關注度比較低，生產商通過宣傳這類功能來吸引消費者的可能性較小，所以市場上不多見。