大豆根瘤病究竟能不能施用氮肥，這個問題一直是農戶的疑慮，針對這個問題進行研究分析。
如果給大豆施用過多的化學氮肥，會抑制根瘤固氮，表現為大豆的根瘤數目減少，瘤小，固氮率降低。
在大豆高產栽培中要適時適量地施用氮肥。完全不同于玉米棉花等其他作物既要選擇氮肥品種，又要控時控量，才有好效果。主要原因是大豆的含氮量雖然高，但體內氮素的來源可從三個方面獲得：其一，土壤養分庫供應有效氮；其二，大豆根上有根瘤，可以進行共生固氮，這是豆科作物氮素的重要來源，當條件適合的時候，根瘤菌的固氮量大約能滿足高產大豆所需氮素的一半左右，甚至更多；其三，才是施肥。