據專家的研究表明：磷肥用得多很容易讓土壤板結、某些中微量元素被固定、缺素癥發生重。因為，小麥吸收不了的磷會富集在土壤中，它的磷酸根離子與土壤中鈣、鎂等中微量元素的陽離子結合形成難溶性磷酸鹽，既浪費磷肥，又破壞了土壤團粒結構，致使土壤板結。因此，底肥上不要偏施磷肥（如磷酸二銨）。
小麥偏施磷，首先是增加成本。今年二銨相當貴，64%的零售價超過3900元/噸。磷是必須的，但無需過量，經驗數據表明：畝用含純磷15%-20%的三元復肥40-50公斤做底肥，一般就不會出現缺磷現象。
施用磷肥時，底肥上選擇磷含量較高的三元復肥，一次性將磷施足。如山東和河北冬小麥區可選擇20-20-5、20-20-7、20-20-8、20-20-10等配方40-50公斤/畝，河南蘇北皖北冬小麥區可選擇22-14-10、25-13-10、27-12-10、27-13-10等配方40-50公斤/畝。
底肥上使用二銨和低氮高磷復肥時，除了畝用量用到30-40公斤外，每畝還要增加尿素10公斤，以防秸稈腐爛和幼苗二者爭氮引起苗黃現象。
從2008年開始，鉀肥價格暴漲，導致農業生產施鉀量越來越少。這種情況已經持續了接近4年，而且近兩年以來，華北地區夏玉米和冬小麥的倒伏情況有增加趨勢，在一定程度上說明了補鉀變得至關重要。
還田的秸稈可以提供部分鉀肥。如果底肥上畝用40-50公斤三元復肥，就沒有必要選擇19-19-19、18-18-18的含鉀量特別高的配方。一是今年含鉀量高的肥料價格特別貴，增加成本；二是鉀肥過量，用不了，太浪費。