雞糞發酵后是一種比較優質的有機肥雞糞的養分含量很豐富，既有大量的有機質，又有含量較高的三要素養分，有機質含量為25.5%，氮素為1.63%，磷素1.54%，鉀素為0.85%，雞糞含量相當于牛糞三要素含量的4.5~7.7倍，所以說數量較少的雞糞也是一種重要的有機肥。
那么雞糞做基肥，有什么好處，又有什么隱患呢？果樹的小葉病黃葉病跟它是否有關？使用雞糞比使用商品有機肥的成本還高，是不是真的呢？
注意，雞糞不被處理或腐熟不好而直接施用到作物上，則存在很大的害處及隱患，主要表現在：
①傳染病蟲害。糞便中含有大腸菌、線蟲等病菌和害蟲，直接使用會導致病蟲害的傳播、作物發病，對食用農產品的人體健康也產生影響。
未腐熟有機物料在土壤中發酵時，容易滋生病菌與蟲害，也導致植物病蟲害的發生；尤其是果樹上，使用不腐熟雞糞很容易導致果樹根部根結線蟲爆發，就是你看到的一個個像小瘤子的東西堆積在根部，“劫走”了根部的營養，阻礙了水分、養分的運輸，使果樹由壯變弱（小葉黃葉）而衰（根腐）而亡……
圖一
圖二
圖一：果木上線蟲危害狀圖二：蔬菜上的線蟲
②發酵燒苗。不發酵的生糞等有機物料施到地里后，當發酵條件具備時，在微生物的活動下發酵，當發酵部位距根部較近且作物植株較小時，發酵產生的熱量會影響作物生長，燒毀作物根系，嚴重時導致植株死亡。
③毒氣危害。在分解過程中產生甲烷、氨等有害氣體，使土壤和作物產生酸害和根系損傷。尤其在棚室內，危害更為嚴重。
④土壤缺氧。有機質在分解過程中消耗土壤中的氧氣，使土壤暫時性的處于缺氧狀態，會使作物生長受到抑制。
⑤肥效緩慢。未發酵腐熟的有機肥料中養分多為有機態或緩效態，不能被作物直接吸收利用，只有分解轉化成態才能被作物吸收利用，所以未發酵有機肥直接施用時使肥效減慢。
⑥成本高未經處理直接使用，有機物料體積大，有效成分低，運輸不便，使用成本提高。
所以習慣使用雞糞的農民朋友請注意了，在施用前必須經過充分的腐熟，提高肥效，減少不必要的損失。
那么發酵好的雞糞有機肥有什么作用：
1、產生多種和酶，抑制重茬病、根結線蟲病、枯萎病、青枯病和疫病等多種土壤傳病害。
2、含有的高效有益微生物菌群持續不斷活動，能活化空氣中氮素、分解釋放難溶的磷鉀養分。補充土壤有機質，緩慢釋放作物生育所需之營養要素。
3、改善土壤物理性，使土壤保持松軟，耕作容易，促成土壤團粒結構，增加土壤孔隙，促進根群生長。增加土壤保水、保肥能力，減少淋洗損失。
4、綠色環保，提高肥效。本品發酵的有機肥副作用，對作物和土壤環境，與無機化肥混用還大大提高化肥的使用效率，節約成本。
5、強根壯苗，防病抗病。有益微生物的大量繁殖向外界分泌激素、多糖等代謝產物，抑制土壤病原菌的滋生，能促進作物根系發達，生長旺盛，減少各種病害發生蔓延。
那么判斷雞糞充分腐熟的標準是什么呢？
無惡臭、有白色菌絲、雞糞成松散狀
同時具備以上三條就可以大體判斷出雞糞已經基本發酵好了。
自然條件下一般歷時2-3個月，堆積溫度達到六、七十度時需要翻倒，中間共需要翻動3-5次。如果加入發酵菌劑，這個過程會大大加快，視環境溫度，一般需要20-30天，而在工廠化生產的條件下7-10天就能完成，經過造粒、添菌、補礦質元素等流程終成為商品有機肥。