芥藍和其它的作物不太一樣，它的生長期長，主薹、側薹采收期長，很多特別的特性，所以對肥水要求嚴格。施肥澆水，應掌握下列原則：基肥與追肥并重，在注意施基肥上進行多次追肥，應輕施，勤施。首先，幼苗緩苗后至抽薹前每隔4-5天要追施少量的氮肥或人畜糞，促進幼苗生長。
其次，在植株現蕾抽薹時要加強肥水管理。增加施肥次數和濃度，每次追施適當的性肥料或人糞尿，還可追施硫酸鉀等肥。此時期是芥藍花薹的品質和產量。第三，在大部分植株主薹采收后，要促進側薹的生長，應重施追肥2-3次，即每次采收后，隔2-3天，待采收傷口愈合后，追施一次腐熟的人畜糞。否則，切口有感染軟腐的可能。還可采用培肥方法，使用腐熟人畜糞等優質有機肥施入株行間，從而提高芥藍的產量。生長過程要經常保持80%-90%的土壤相對濕度。芥藍葉面積較大，葉片鮮綠油潤，蠟粉較少，是水分充足、生長良好的標志；葉面積較少，葉色淡，蠟粉多，是缺水的表現，應及時灌水。應注意追施糞水不要澆到花薹上。