氮肥的市場一直不太景氣，我國土壤的氮肥利用率很低，一般只有30%左右。據試驗測算，在畝土壤中，作物多只能吸收不超過40公斤的氮，其余多出來的氮則通過雨水滲入地下。中國農業科學院土壤肥料研究所提供的一項報告表明：我國部分地區氮肥用量偏高，特別是城市周圍蔬菜種植區域氮肥用量過高，已引起了非常嚴重的地下水污染。
氮肥造成污染的主要成分是其中所含的硝酸鹽。硝酸鹽對人類的危害是它進入人體后會變成亞硝酸鹽，進而在體內化合形成亞硝基化合物，該物質是一種強致癌物，特別容易引起消化系統的癌癥。醫學研究，當飲用水中的硝酸鹽含量超過90毫克/公斤時，就會危及人類的健康。而在我國北方15個縣市連續3年對地下水和飲用水進行測試，有近一半地下水和飲用水不符合人類健康飲用水標準，含量的達到300--500毫克/公斤。