生產優質高產的大豆產品，必須采用相應的科學施肥技術。首先需要根據品種的特性及各時期的生長特點，及時有效的施用有機肥，來促進大豆生長發育，提高產量和品質，增加生產效益，進而實現綠色食品。因此，在選擇應用有機肥時要考慮肥效明顯，具有改良土壤緩解藥害、促進成熟、提高品質的優質產品。
一般大豆從花期開始進入生長旺盛階段，株高、葉面積系數和干物質積累均較快，所需營養物質也較多，但此時土壤中可利用養分通常下降到低值，養分供應不足，所以在大豆初花期追氮肥能顯著提高干物質積累和光合速率，是大豆高產的有效措施。
追施氮肥還應根據植株的長勢和土壤肥力情況靈活掌握，如豆苗瘦弱、土壤瘠薄，追肥時間應適當提前，以促進營養生長，搭好豐產架子。苗期已追肥的地塊，如果開花期仍缺肥，可補追一次。若豆苗生長健壯，葉面積系數過大，土壤堿解氮含量在80毫克/千克以上，初花期就不必追氮肥，以免造成徒長和倒伏。以每畝追施10-15千克的尿素，瘠薄地和弱苗可適當多追。追肥以溝施為好，尿素也可撒施于行間，好結合中耕和灌水進行，以確保肥效。撒施應避免將肥料撒在葉片上，以防葉片。
磷肥一般用作底肥施用。如缺磷，可于大豆苗期或初花期開溝追施磷肥。若嚴重缺磷，結莢期仍需追施磷肥。追肥數量一般以每畝追施25千克左右的過磷酸鈣或其他等量的磷肥，嚴重缺磷時可適當多施。大豆在結莢期之后追磷要少些。因為磷在土壤中移動范圍很小，必須施在耕層，好溝施；在大豆鼓粒期追施磷肥，好采用根外噴施。
葉面噴施是用于植物根部以外的一種追肥方法，一般用噴霧器將肥料溶液或干粉噴灑于作物葉面或葉背。葉面噴施可直接通過葉片吸收肥料，并快速運輸到各器官，參與體內生物化學過程，能顯著提高產量，改善品質。因為這種方式不通過土壤，養分不會被土壤固定，肥料利用率高。但這僅是根外追肥的一種方式，不能代替根部追肥。