蔬菜生產中的施肥策略以有機無機相結合的原則，有機肥的施用量要合理，而不要多多益善。首先掌握所施有機肥的養分含量，充分估算其對作物所供應的氮、磷、鉀養分數量，要扣除有機肥所能提供的養分數量后，不足的部分再施用化學肥料補充，但是當前生產實踐中，菜農往往不算有機肥養分只算化肥養分，而導致普遍存在著過量施肥的問題。
其一，關于有機無機的適當配比：以滿足蔬菜作物周年所需氮素的供應量為例，有的國家提出，來自有機肥中的氮素比例占50%-60%為宜。糧農組織曾推薦，按照有機氮與無機氮之比為1∶（0.4-1），并以此確定有機肥與化肥的施用量。
其二，針對菜地土壤的質量特征選擇不同種類有機肥，新菜田應選用化學養分高、的發酵有機肥，如糞尿、綠肥、餅肥；老菜田應選用含秸稈豐富，經過堆漚發酵的緩效有機肥。有些連作障礙嚴重的老菜田采用秸稈生物反應堆技術效果很好，就是利用秸稈改善土壤物理性狀，又補充了充足的碳源。在有機肥種類中，選用堆肥產品包括糞尿秸稈固體垃圾等可提高蔬菜作物抗性和促根效應，改良土壤pH和土壤結構，提高土壤有機質數量，鈍化菜田重金屬活性，減輕重金屬污染風險。
其三，有機肥施用時期，總的原則是針對有機肥具有緩效性的特點，將它作基肥或底肥施用，在播種或栽插前施用。不用它作追肥，要用化肥作追肥。
為此要制定合理的基追肥比例，對于高產果菜類作物，適量減少基肥施用量，增加追肥施用量。還有就是，要控制肥水投入，以便減少菜地的氮、磷養分的累積、淋洗和徑流損失，減輕面源污染。