五味子是多年生植物，栽后要在有限的營養范圍內連續生長10年以上。隨著栽培年限的延長，土壤中的營養會逐漸減少，地下橫走莖分布龐大，長勢旺盛，營養消耗多，因此合理施肥對五味子生長很重要，施肥的方法和用量應注意以下幾個方面。
五味子移栽當年根系不發達，枝條細弱，為了催苗，爭取第二年見果，可在5月下旬追1次尿素，每畝10公斤，以滿足對氮肥的需要。第2次追肥在6月下旬至7月上旬，每畝追施尿素10公斤，過磷酸鈣15公斤、硫酸鉀10公斤，方法是開溝0.3米深將3種肥料混合后均勻施入土壤中。第3次施肥在9月上中旬，每畝施入腐熟農家肥2500公斤，以備翌年春季利用。
前2次追肥要結合灌水，第3次施肥可不灌水，施肥后要覆土。五味子從移栽第1年起，每年都要進行施肥，施肥方法和種類大致相同，但以后的施肥量要根據樹體長大程度相應增加，施肥時期要根據生長發育特點進行。
例如在5月下旬至6月初，是五味子開花期也是新梢生長高峰期，6月末至8月初是果實膨大期，7月下旬至8月中旬是花芽形成期，也是新梢第二個生長高峰期。在這幾個關鍵時期，五味子需肥量特別大，要及時追肥，同時還要采取快成本低的葉面施肥。在6月份噴施0.5%尿素2次，每次間隔7-10天；7月份以后噴施1-2次0.3%磷酸二氫鉀或植物氨基酸液，每畝200-250克。選在早、晚進行噴施，避免在暴熱和雨前噴施。另外噴施尿素要注意縮二脲含量不超過0.5%，以免傷害葉片。