溫室蔬菜很多人都認為是施肥越多越好，其實溫室種植的蔬菜多施肥反而不好。施肥過多容易引起肥害。
在實際的生產中，施加化肥或性有機肥料如果一次施加過高，有可能造成作物根系吸水困難，僵苗不發，葉片導致畸形，嚴重時農作物會逐漸萎蔫而枯死。解決的方法是平衡施肥。由于大棚相對密封，施入化肥不易淋失，肥效較高，宜多次少量看情況施肥。還是要根據蔬菜產量、土壤肥力、不同肥料元素利用率等確定合適的施肥用量，用來進行平衡施肥。
溫室蔬菜還要采用正確的施肥辦法。如果在生產中碳銨施加方法不當造成的危害就非常明顯。碳銨俗稱氣肥，施加進入土壤后，會很快地分解成為氨和二氧化碳。并且氨對蔬菜葉片有很大的毒性，在空氣中的濃度達到一定程度時，首先致使靠近地面的蔬菜葉片出現氨中毒而變黃脫落；濃度達到時，則會造成整個溫室大棚植株葉片脫落，蔬菜絕收。
所以無論是哪種肥料都應該要注意合適的施加辦法。