綠色蔬菜在施肥技術上要求：以有機肥料提高土壤肥力水平為基礎；插入豆科作物以提高土壤含氮量，減少化學氮肥用量；嚴格掌握氮肥追肥時間，控制菜體硝酸鹽的含量。在生產符合綠色食品標準的蔬菜的過程中，對化肥施用應有正確的認識。
1.適當控制氮肥用量 為了綠色食品標準的蔬菜有較好的產量和經濟效益，在施用有機肥料的基礎上，適當施用氮肥是必需的，但一定要控制用量。在目前綠色食品蔬菜未按質論價的情況下，不施用化學氮肥很難解決質量與產量、產量與效益之間的矛盾，菜農也是難以接受的。
2.嚴格掌握氮肥的追肥時間 蔬菜作物的硝酸鹽含量是不斷變化的。因為，進入蔬菜體內的氮素，在代謝過程中，進一步轉化為氨基酸，合成蛋白質。據研究，隨著氮肥追施時間的推移，蔬菜體內硝酸鹽含量有逐漸減少的趨勢。現經每畝施5000公斤有機肥和25公斤硫酸銨追肥的油菜為例，油菜中硝酸鹽含量從追肥3天后的5372毫克/公斤，降到14天后的877.4毫克/公斤，和18天后的653.8毫克/公斤，已符合綠色食品標準。因此從考慮，綠色食品蔬菜的追肥時間應在采收前15～20天為宜。此外，氮肥與鉀肥配合施用，能促進蛋白質的合成，減少體內硝酸鹽的含量。
3.綠色食品和施用化肥并不矛盾 不要把綠色食品與施用化肥對立起來，化學氮肥是蔬菜可直接吸收的無機態氮源，而有機肥料經過微生物分解，使有機態氮轉化為無機態氮，它后來也是以無機態氮素供蔬菜吸收的。因此，認為“施用化學肥料的蔬菜不是綠色食品標準的蔬菜”，而“施用有機肥料的蔬菜才是綠色食品標準的蔬菜”的看法是不正確的。其實，某些大量施用有機肥料的蔬菜，體內硝酸鹽含量也不少。
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