大豆屬于油料作物，大豆本身可自行固定空氣中的氮素，因此，施氮量可適當減少，磷肥鉀肥的供給量相對就較多一些，一定要根據大豆的需肥特點來施肥。
大豆種植面積以北方居多，特別是東北地區，東北是我國主要的大豆產區，而南方花生面積較大，在這些地區都有大面積缺磷的泥土，所以，大豆施肥時，磷肥都是主要的肥料。一般情況下，北方施用磷肥應以水溶性的為好，如普通過磷酸鈣等，南方能夠施用檸檬酸溶性磷肥，如鈣鎂磷肥等。在酸性泥土上，鈣鎂磷肥肥效能夠超過普通過磷酸鈣，因為它不僅含有磷，而且還有鈣、鎂。這是酸性泥土上常缺的養分。
不管是南方還是北方，如果把磷肥與腐熟的有機肥混雜后施用，都能夠提高磷肥效果。通常的混雜比例是1：5-10，即1份磷肥加5-10份有機肥，有機肥一定要腐熟的品質好的，而不是通常的土糞。
大豆在北方種植時，農民常施用一些草木灰。施用草木灰能夠改良鉀素平衡，避免泥土鉀素耗費太多，但施草木灰時，要注意與除鉀肥外的化學肥料或有機肥料如廄肥、人糞尿混雜堆漚的混雜，否則可能引起氮素喪失和磷素的退化。
大豆在肥力一般的泥土上，作基肥用的肥料氮、磷比例大體上能夠維持在1：2的領域，即一份氮素兩份磷素。如每公頃施（P2O5）60千克（即每畝4千克）時，每公頃可施氮素30千克（即每畝2千克）。如果施用的有機肥量大，能夠恰當減少化肥用量。當基肥較少，或泥土肥力較低時，通常可在初花期追施一部分氮肥，但數量不能過大，否則易引起陡長，反而對結籽不利。