據農業部調查，全國萵苣生產中有機肥施用量少，盲目偏施氮肥現象突出，磷鉀肥施用量不足，萵苣施肥時期和方式不合理。
萵苣施肥原則：（1）增施有機肥料，控制氮肥，增施磷、鉀肥；（2）肥料分配方式以基、追結合為主。追肥以氮肥為主，合理配施鉀肥；（3）酸化嚴重的菜園，應適量施用石灰等酸性土壤調理劑；（4）施肥與優質栽培技術特別是水分管理結合，以提高肥水利用效率。
萵苣施肥建議：（1）基肥一次施用腐熟農家肥每畝1000～1500公斤。（2）畝產量水平3500公斤以上：氮肥16～18公斤（每畝，折純，下同），磷肥7～9公斤，鉀肥8～10公斤。（3）畝產量水平2500～3500公斤：氮肥14～16公斤，磷肥5～6公斤，鉀肥6～8公斤。（4）畝產1500～2500公斤：氮肥12～14公斤，磷肥4～5公斤，鉀肥5～6公斤。
萵苣耐酸能力差，南方地區菜園土壤pH＜5時，每畝需施用生石灰150～200公斤。
氮肥全部做追肥，按照20%、30%和50%在移栽返青期、蓮座期和快速生長初期分3次追施，鉀肥40%～50%基施，其余部分在蓮座期和快速生長初期分兩次追施，磷肥全部作萵苣的基肥條施或穴施。