化肥與農家肥配合需注意三個方面，即施用時間、施用方法、施用數量，三者缺一不可。
施用時間。農家肥慢，應早施，一般在播前一次性施入；而化肥用量少，快，一般應在作物吸收營養高峰期前7天左右施入。
施用方法。農家肥要結合深耕施入土壤耕層，或結合起壟扣入壟底。與農家肥搭配的氮素化肥，30%作底肥，70%作追肥，磷肥和鉀肥作底肥一次性施入。
施用數量。如在瘠薄的土壤里種玉米，每畝可施農家肥4立方、尿素24公斤、磷肥13公斤，或施3個15%的復合肥13公斤；中等肥力土壤可施農家肥3立方、尿素20公斤，或施3個15%的復合肥12公斤；高肥力土壤可施農家肥2.5立方、尿素15公斤。尿素在追肥時使用效果更佳，復合肥以底肥為佳。