在使用碳酸氫銨時一定要注意一下幾點：
不宜表土撒施：碳銨易揮發流失損氮，據測定：在氣溫28℃時，表土撒施碳銨12小時內損失氮素20%，而深施10厘米處蓋土時，12小時內損失氮素不到1%，同時碳銨表施還容易被雜草消耗，所以肥料的利用率僅有30%左右；深施融肥于土，肥料利用率可提高20%~30%。
不宜作種肥施碳銨具有較強的腐蝕性和揮發性，對種子有強烈的腐蝕作用。用它作種肥或拌種，對種子發芽和幼苗生長會產生嚴重危害。要作種肥，只能開溝穴施，不和種子接觸。
不宜葉面噴施碳銨易溶于水，溶后分解成銨離子，對作物葉片有、熏傷的危害，造成葉片斑斑點點的損失。噴施的肥液濃度高、用量多，還會造成作物毀壞，需要進行補種或耕翻再種。故碳銨不可進行葉面噴施，適宜土壤深施，與有機肥混施。
不宜烈日追施碳銨的弱點是易揮發失氮，其揮發的速度與溫度高低成正比。據測定：碳銨在空氣中放置15天，氣溫在12~14℃與16~18℃時，分別揮發失氮60%和95%；在28℃時，7天內全部氮素揮發損失。所以碳銨不宜在晴熱天高溫烈火日下施用，應在上午10時前無露水和下午5時后，氣溫較低時施用，避免烈日直射下施用造成氮素損失。
不宜有露水施在早晨或雨后作物葉片上有水滴、露水未干，不可追施碳銨。碳銨腐蝕作用強，若肥液沾在有水的葉片上，容易葉片，造成植株損傷。
不宜堿肥混施堿性肥料有草木灰、鈣鎂磷肥、石灰等，碳銨不可與這些堿性肥料混合施用，否則會造成碳銨中氮變成氨氣揮發，肥效損失快、浪費嚴重。
不宜與過磷酸鈣混合過夜再施
碳酸氫銨與過磷酸鈣混合施用，雖然比分別單施效果好，但混合后應立即施用，不宜久放，更不能過夜。因為過磷酸鈣吸濕性強，會使混合肥料變成漿狀或結塊，不利施用，且碳酸氫銨揮發性強，易揮發損失。
不宜與尿素混施碳酸氫銨施入土壤后，造成土壤溶液短期呈酸性反應，會加速尿素的揮發損失，故碳酸氫銨不能與尿素混合施用。
不宜與菌肥混施碳酸氫銨施后會釋放出氨氣，與菌肥接觸，會使菌肥中的活菌體死亡，使菌肥失去效果。