進入冬天后，大棚內往往溫度較高、濕度較大、使得那些過冬的蟲子也活躍了起來，種黃瓜時就比較容易出現蚜蟲、白粉虱、紅蜘蛛、美洲斑潛蠅等，這里介紹幾種不同的防治方法，有用農藥的，也有從土質入手的。
防治上應該以采用抗病品種和培育無病壯苗為基礎，結合生物防治和合理使用高效低毒低殘留農藥的綜合控防技術，科學調控溫度、濕度、水分、營養：
1、輪作和土壤消毒與非葫蘆科蔬菜實行2-3年輪作。也可以在夏季高溫時深翻地25厘米以上，然后覆蓋地膜，持續10-15天，實行高溫或6月份撤棚膜后，種一茬綠豆壓青，以改善土壤環境，用50%多菌靈按1:100配成毒土，每平方米用1.25千克，撒于地面與土壤拌勻，進行土壤消毒。
2、選用抗病、耐病、抗逆性強的品種適宜的品種有津春3號、津優3號、天正2號、魯黃瓜10號等。
3、培育無病壯苗
（1）種子消毒用50%多菌靈可濕性粉劑500倍液，浸泡種子1小時，晾干后播種，對疫病可用種子重量0.3%的25%甲霜靈或50%多菌靈粉劑拌種，對細菌性病害可用55℃溫水浸泡15分鐘防治。
（2）苗床土壤消毒采用50%多菌靈或50%福美雙可濕性粉劑，每平方米用量5-10克。
（3）加強苗床管理在溫室內，覆蓋防蟲網或遮陽網育苗，播種密度不宜太大，并適當通風，控制幼苗徒長，定植前噴1-2次50%多菌靈500倍液防病。
（4）實行嫁接育苗用黑子南瓜做枯木，用抗霜霉病、白粉病等病害的品種作接穗進行嫁接，可有效地防治病害，促進早熟高產。
4、綜合措施防治病蟲害
（1）保護地內設置黃板誘殺白粉虱、蚜蟲、美洲斑潛蠅等，也可釋放麗蚜小蜂控制白粉虱。
（2）可選用1%農抗武夷菌素150-200倍液防治灰霉病、白粉病，兼治黑星病，用2%羅素發1500倍液防治葉螨，兼治美洲斑潛蠅。
（3）合理使用化學藥劑防治重點病害？菸】捎50%多菌靈可濕性粉劑500倍液，或50%甲基硫菌靈可濕性粉劑800倍液進行防治；防治霜霉病選用5%霜克粉塵劑或5%霜霉威粉塵劑，每畝用1千克，兼治疫病、炭疽；防治蚜蟲、美洲斑潛蠅可用10%大功臣可濕性粉劑1000倍液。