我們一般意義上認為殺菌劑是指殺真菌劑，是防治植物病原微生物引起病害的一類農藥的統稱。那么殺菌劑都有哪些分類呢？
一、按殺菌劑的使用方式分
1、保護劑。
這類藥劑原理是抑制病原孢子萌發或殺死萌發的病原孢子，以保護植物免受其害。如硫酸銅、綠乳銅、代森錳鋅、波爾多液、代森鋅、百菌清等。
2、劑。
這類從植物表皮滲人植物組織內部，經過輸導、擴散或產生代謝物來殺死或抑制病原，恢復植物健康。如多菌靈、甲基硫菌靈、春雷霉素等。
3、鏟除劑。
這類能直接殺死已侵入植物的病原物。如五氯酚鈉、福美砷、石硫合劑等。
二、按傳導特性分類
1、內吸性殺菌劑。
能被植物葉、莖、根、種子吸收進入植物體內，具有和保護作用。如多菌靈、甲基硫菌靈、敵克松、粉銹寧、甲霜銅、殺毒礬、力克菌、多霉清、霜疫清、甲霜靈等。
2、非內吸性殺菌劑指藥劑。
不能被植物內吸并傳導、存留，不能防治深入植物體內的病害，只具有保護作用。如草木灰、波爾多液、代森錳鋅、福美雙、百菌清、硫酸鋅、硫酸銅、多果定、綠乳銅、表面活性劑、增效劑、硫合劑等。
三、按殺菌劑的原料來源分
1、無機殺菌劑。
是化學防治植物病害。如硫酸銅、升汞、石灰波爾多液、氫氧化銅、硫磺粉、石硫合劑、氧化亞銅等。
2、有機硫殺菌劑。
是一類含有硫的有機合成殺菌劑。如福美鋅、代森鋅、代森錳鋅、代森銨、敵銹鈉、福美雙等。
3、有機磷、砷殺菌劑。
如乙磷鋁、甲基立枯磷、稻瘟凈、克瘟散、退菌特、稻腳青等。
4、取代苯類殺菌劑。
是指化學結構中含有苯環的有機殺菌劑。如百菌清、敵克松、甲基硫菌靈、五氯硝基苯等。
5、唑類殺菌劑。
對作物會產生一定的抑制作用。如粉銹寧、多菌靈、惡霉靈、苯菌靈、噻菌靈等。
6、抗菌素類殺菌劑。
抑制許多植物病原菌的生長和繁殖。如春雷霉素、農用鏈霉素、井岡霉素、多抗霉素、抗霉菌素120等。
7、復配殺菌劑。
如滅病威、雙效靈、炭疽福美、殺毒礬M8、甲基硫菌靈·錳鋅、廣乳粉、甲霜銅、DT殺菌劑等
8、其他殺菌劑。
如甲霜靈、菌核利、特富靈、敵菌靈、瑞枯霉、腐霉利、撲海因、丹、克菌丹、福爾馬林、高脂膜、菌毒清等。
農藥殺菌劑發展至今已是一種普遍使用的農作物殺菌藥劑，對農作物病害的防治都離不開農藥殺菌劑。