冬季大棚蔬菜栽培由于通風條件差，溫度低，濕度較大，無論是施肥還是使用農藥都要講究科學，否則會降低肥料利用率，甚至會出現肥害、藥害，生產中應注意以下幾點。
不宜多施碳銨肥。碳銨施用后會揮發出大量氨氣，會導致氨氣中毒，對蔬菜生長不利。但碳銨是冬暖大棚蔬菜追肥的肥料，即使在5℃的土溫時，也能轉化分解被作物吸收利用，但施用時應注意深施，一般在離蔬菜根莖8-10厘米處開10厘米深的溝，撒施后用土蓋嚴，可提高利用率10%-30%。
不宜地表施用磷肥。磷容易與土壤中的鈣、鐵、鋁起化學反應產生土壤固化，失去肥效，因此磷肥適合作基肥或在蔬菜前期集中施于根系密集的土壤中，一般在移栽行開8厘米深溝，撒入磷肥后覆土4-5厘米，然后在淺溝內移栽蔬菜，縮短磷肥與作物根的距離來彌補磷移動性小的弱點。
不宜夸大葉面肥的作用。大棚蔬菜在施足基肥的前提下，改土壤追肥為葉面噴肥，不但可以省工省肥，不損傷作物莖葉，而且肥效快，可促進作物成熟防止早衰，延長供應期，有利于提高蔬菜品質。但采用葉面施肥主要是幫助作物補充一些微量營養元素或生長調節劑等，這對于提高作物的產量和改善品質也是很必要的。但因葉面肥肥效有限，是一種輔助施肥方式，不能代替根部施肥，故不能夸大葉面肥的作用。
對于農藥的使用應注意六點要求：
一、每種農藥都有一定的防治范圍和防治對象。用藥要有針對性，不能盲目，憑借經驗；
二、嚴格遵守的說明來調節的濃度、比例和用量；
三、用藥要有間隔性，不能無間斷，重復使用藥劑，否則會傷及秧苗，出現藥害；四、在蔬菜生產中應選用高效、低毒、低殘留的農藥品種，切忌隨意增加藥液濃度，嚴禁使用劇毒性農藥；
五、不同類型、不同作用機制的農藥應合理交替使用；
六、根據病蟲害發生的規律，應在病蟲害發生初期施藥。考慮到棚內溫暖潮濕的環境，不宜在陰雨天或溫度高的情況下噴藥，以防止棚內濕度過高，降低藥效。
應采取“配方施肥”方式。冬季大棚蔬菜施肥應先測定土壤中的氮、磷、鉀比例，再根據需要配方施肥。不同種類蔬菜對氮、磷、鉀的需求量是不同的，如茄果類蔬菜對鉀、鈣、鎂的需求量大；葉菜類蔬菜在結球期要氮、鉀供應充足；根莖類的蔬菜應注意在根莖膨大前追施磷肥、鉀肥和硼肥。