在不同的時期防治馬鈴薯晚疫病要有不同的方法，馬鈴薯晚疫病總體防控策略，要實施以推廣抗病品種和脫毒種薯為基礎，種薯處理、健身栽培和預測預報指導下，藥劑防控相結合的綜合防控措施，大力推進專業化統防統治，及時有效控制病害流行。
播期防治
推廣抗病脫毒種薯，播種前淘汰病爛薯，提倡小種薯播種，需切塊時，切刀用酒精、高錳酸鉀或福爾馬林浸泡消毒；種塊可選用惡霜錳鋅或霜脲·錳鋅等藥劑拌種，旱作區可用馬鈴薯專用浸種劑加上述兩種藥劑混合拌種，種薯拌藥后避光晾干播種。避免與茄科類、十字花科類作物輪作或套種，禁止與番茄輪作。
生長期防治
1.加強監測預警。采取系統監測與田間實查相結合，定點調查與大田普查相結合，確定防治時期。
2.中心病株處理。當發現中心病株時，要連根及薯塊全部挖出，帶出田外深埋（深度1米以上）或銷毀，對病株周圍50米范圍內噴施霜脲·錳鋅或氟吡菌胺·霜霉威等藥劑進行封鎖控制，隔7天噴1次，連噴3次，阻止病害擴展。
3.控制徒長。在現蕾期當株高30-40厘米，且有徒長跡象時，采用烯效唑或馬鈴薯專用植物生長調節劑均勻噴霧控制徒長。
4.藥劑控病。從現蕾期始噴施1~2次保護性殺菌劑，如代森錳鋅、氰霜唑、丙森鋅、雙炔酰菌胺等進行預防；田間見病后，重發區應立即組織開展專業化統防統治，選用性殺菌劑，如烯酰嗎啉、氟吡菌胺·霜霉威、惡唑菌酮·霜脲氰、霜脲·錳鋅等藥劑噴霧防治2~4次，常發和偶發區根據監測預報選用上述藥劑防治2~3次或用申嗪霉素、枯草芽孢桿菌等生物制劑防治。均勻周到噴藥，噴藥后4小時遇雨應及時補噴。注重輪換用藥，適當利用有機硅助劑提高藥效。
5.收獲前預防塊莖感病。馬鈴薯收獲前一周進行殺秧，把莖葉清理出田外集中處理。殺秧后地表噴施一次霜脲·錳鋅或嘧菌酯預防塊莖感病，選擇晴天收獲。
貯藏期管理
入窖前剔除病薯和有傷口薯塊，在陰涼通風處堆放3天。貯藏前用硫黃、腐霉利·百菌清或三氯異氰脲酸熏蒸消毒貯窖。貯存量控制在貯窖容量的2/3以內。貯藏期間加強通風，溫度控制在1-4℃范圍，濕度不高于75%。
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