在芝麻生長的季節是降雨量比較多的季節。在多雨的季節，如果芝麻田里沒有施用除草劑，常常雜草叢生，青枯病、莖點枯病、枯萎病和疫病等芝麻病害也會相繼發生。草害與病害極易導致芝麻大幅度減產，要及時做好預防工作。
對于芝麻的田間雜草，可選用多種除草劑噴施，一可在播種前5-7天，每畝用48%氟樂靈乳油100-150毫升，兌水50公斤施于土表，隨即耙土翻埋，混土后才能播種；二可用48%拉索乳油，每畝150-200毫升兌水75-100公斤于芝麻播種之后出苗之間噴于土表層；三可用50%乙草胺乳油70-80毫升兌水75-80公斤噴施；四可用10.8%蓋草能乳油25-30毫升兌水15-20公斤于芝麻出苗之后雜草3-4片葉時噴施，均能取得較好的預防效果。
對于芝麻病害的防治，一是在芝麻出苗后用1∶1∶100倍波爾多液或0.1的硫酸銅液噴施；二是在芝麻發病初期用70%代森錳鋅可濕性粉劑800倍液；三是用58%甲霜靈·錳鋅可濕性粉劑500-600倍液；四是用40%多菌靈或70%甲基硫菌靈可濕性粉劑500-800倍液；五是用40%乙磷鋁可濕性粉劑300倍液等藥劑，噴施1-2次。各地可結合當地的實際情況靈活選用。
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