一、防治時間不當
如有些農藥使用時要求趁露水未干時使用，以增強藥液在作物體表的吸附性；有的人不顧用藥環境、用藥時間，主觀盲目亂用藥。
二、不看清使用說明，隨意增減濃度
憑老經驗用藥，殊不知濃度高了提高成本，造成浪費，太高了還會產生藥害，造成環境污染；濃度低了又達不到殺滅病蟲的目的。
三、藥沒有打到作物要害部位
因病蟲而異，有的濃度須噴施到基部、莖部、葉部或頂部（心葉里）、或毒土根外撒施等，必須對癥下藥，對“位”下藥。
四、使用失效農藥
農藥久置會導致揮發、變質、失效（分層、沉淀等），降低藥效。揮發性強的農藥尤其如此。亞胺硫磷久置結晶出來，使用時須使晶體溶解后再用。敵敵畏必須在陰涼，干燥、密封條件下保存，且不宜久置。保存農藥時有人不注意這一點；不能一次用完的農藥，甚至噴至中途把藥液擱在噴霧器里隔幾天后又用，影響了藥效。
五、病蟲藥劑不分，張冠李戴
以殺蟲劑治菌、殺菌劑治蟲，用防治某病（或蟲）的藥劑來防治另一種對其無效的病蟲的例子也有不少。
六、不分作物使用藥劑
有的藥劑只適用于某種或幾種作物，如亂用在其他作物上，有可能無效果，敏感作物還會產生藥害，殘毒等。敵敵畏對瓜、豆等易產生藥害，盡量不用或慎用，也可改用其他藥種。
七、盲目混配
不懂農藥的理化性質，盲目復配、混用以求兼治多種病蟲，結果把互相干擾各自效應或能起反應的幾種藥劑混配在一起使用。如多菌靈不能與銅制劑混用；西維因不宜與樂果、堿性農藥和化肥混用；防治稻棉害蟲的殺蟲脒不宜與堿性農藥混用等等。
八、掌握不好防治適期和防治標準
不懂病蟲害消長規律，見蟲就打，見病就噴的現象仍較普遍。打早了，病蟲情況還未穩定下來，藥效過了病蟲又發展起來，打遲了一時又難以控制或造成一定的損失。
九、重蟲輕病現象
蟲吃莊稼時可見，但病的危害就不如蟲直觀，防治中往往顧此失彼，顧蟲失病。
十、長期單一用藥，致使病蟲產生抗性
一地、一茬、一作物、一病蟲，不宜長期套用一種（類）農藥，否則病蟲易產生抗性。如多菌靈，必須與其他農藥混用或輪換使用，才能克服“抗藥性”弊端，提高防效。
上述因素是防治效果差，防效不顯著的重要、常見、也是常常被人忽略的原因。因此，講求科學、準確地使用農藥，取得預期的效果，必須系統學習植物保護知識，用前讀懂使用說明，對使用濃度、施藥適期、防治對象、適用作物及其具體施藥操作和方式等等事項都搞清楚，才能達到經濟、、高效的目的。當然在購買農藥時仍要仔細識別農藥，避免買一些“偽劣農藥”。