棉花疫病是棉花鈴期嚴重的病害，南北棉區每年均有不同程度的發病二棉花整個生育期均可發病，苗期和鈴期尤為突出。可引起大量死苗和爛鈴，嚴重影響棉花生產。
棉花疫病的癥狀：
苗期發病。棍部及莖基部初呈紅褐色條紋狀，后病斑繞莖-周。弓及莖基部壞死，引起幼苗枯死子葉及幼域真葉受害，病斑多從葉緣開始發生，初呈暗綠色水漬狀小斑，后逐漸擴大成墨綠色不規則水漬狀病斑。在低溫高濕條件下迅速擴展，可蔓延至頂芽及幼嫩心葉，變黑枯死；在天晴干燥時，葉部病斑呈畏水褪綠狀，中央灰褐色，成不規則形枯斑，葉部發病，子葉易脫落。為害棉鈴，多發生于中下部果枝的棉鈴上。多從棉鈴苞葉下的鈴面、鈴縫及鈴尖等部位開始發生，初生淡褐、淡青至青黑色水漬狀病斑，不軟腐，后期整個棉鈴變為有光亮的青綠至黑褐色病鈴，多雨潮濕時，棉鈴表面可見一層稀薄白色霜霉狀物。
棉花疫病的的防治方法：
農業防治。實行間作套種，改善通風透光條件；深中耕、高培土，排除積水，降低土壤濕度；精細整枝，實行化控；清潔棉田，及時治蟲等。
藥劑防治。用70%的代森錳鋅200～400倍液+新高脂膜+植物細胞免疫因子每隔10天噴霧一次，連噴2～4次，提高殺蟲力度，提升植物抗逆性，可使病毒DNA斷裂凋亡。強大免疫功能，誘生干擾素和活性細胞介素，抑制殘余病毒復制，促進植物正能量生態生長。
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