因為近連續的高溫少雨天氣，這對黑木耳菌棒的培育會造成不好影響，管理不恰當會引起“高溫燒菌”以及“吐黃水”等生理性病害及綠霉菌等病害性污染加重，到后期甚至會出現嚴重的“爛棒”。下面筆者對菌袋抗高溫管理上提出如下幾個要點：
一、制袋期技術要點
1、防止高溫進行接種。在溫度超過35攝氏度的時候，需要選擇夜間溫度相對比較低時進行接種。接種方法主要是以接種箱接種比較。
2、選用適宜菌齡優質的菌種。應該選擇高抗品種比如“916”，菌齡適宜的品質好栽培種，嚴格禁止使用“吐黃水”的老化菌種。
3、不失時機進行接種。在給料袋殺滅病菌之后，在清潔的環境中冷卻到室溫之后馬上接種，要求在2到3天之內接種完畢。
4、套袋培菌。在溫度很高期間接種的菌袋，需要和套袋法配合培養菌袋，防止接種塊受到外界干燥及污染空氣危害而對發菌造成危害。
二、培養期管理技術要點
1、在大棚內氣溫超過35攝氏度的時候，可以采取棚頂噴淋方法來降低溫度，將氣溫掌握在35攝氏度以下；在防止陽光照射菌袋的基礎下，將周圍遮陽網開啟，增強對流通風；并且采取風機輔助散熱技巧，防止局部堆溫太高，導致菌袋“燒菌”。
2、降低菌棒翻動的次數，防止造成菌棒人為升溫。