據了解，大蔥銹病的病菌會隨著冬孢子在病殘體上進行越冬。大蔥銹病會借助雨水、氣流進行傳播，再次進行感染和侵染。
大蔥銹病的病害主要危害葉片和花梗上形成的橢圓及隆起的小瘡皰，中部會呈現出桔色，周圍為黃白色，有光澤。隨后病害逐步蔓延，周圍表皮會翻起，散出鐵銹色的粉末。隨著病害的蔓延，與病斑相鄰都會出現長橢圓形的斑點。斑點會漸漸的縱向破裂，散出紫褐色的粉末。嚴重的情況下，大銹蔥病會逐漸危害蔥頭。同樣，大蔥銹病會危害大蒜及韭菜。大蔥銹病在低溫多雨及高溫高濕的環境條件下，很容易引發大蔥銹病的發生和流行。
為了及時的防治大蔥銹病，應采取有效的措施。發現病害的大蔥及時的摘除，并摘除病葉，將病葉帶離種植區域，大蔥銹病的病殘體，會將其進行深埋或銷毀；在大蔥種植后，應施足充足的有機肥料，進行增施鉀肥，可以有效的提高大蔥植株的抗病能力。進行及時的澆水，在大蔥銹病發病初期應及時的選用噴施15%三唑酮2000-2500倍液，或40%硫懸浮劑400倍液，或25%敵力脫乳油3000倍液；70%代森鋅1000倍液加15%三唑酮2000倍液；25%敵力脫4000倍液加15%三唑酮2000倍液，每隔7-8天噴一次，效果顯著。