樹樁盆景整個創作過程的剪枝可分為科學剪枝法、技術剪枝法和藝術剪枝法，當作品創作完成，定型后，還要進行一項長期性的修剪，即控制剪枝法。
科學剪枝
應用植物生理學作指導，以掌握各種植物生長規律及特性，根據樹種的不同、長勢的強弱、季節的變化有針對性地進行剪截，以避免盲目修剪植物帶來體內堵塞、生長失調及窒息枯萎的不良后果。樁景層次過多，枝葉過密，或是上層枝片過大，會造成植物通風不好，光照不足，出現死枝、病蟲害現象。植物的修剪必須符合樁景自身的生長特點，樹冠造形宜于采用收尖漸變，結頂自然，不搞大屋頂的造型手法。科學剪枝的目的是應用植物生理學知識，正確地引導植物生長，發揮它們的生長優勢，以便更好地控制、利用和改造它們。
技術剪枝
技術剪枝是為構圖服務的，它要求樁景在外形上給人產生一種直觀的形象的效果；也是為了突出盆景意境魅力的一種手段。它在很大程度上是一種符合于樁景的意境和藝術表現的技法，又是服務于內容的一種外在的技法。如果技術剪枝掌握得不免嫻熟、不免準確，應會制約意境的深遠，也將不能更好地表達主題。眾所周知：一盆有價值的樁景是與技術修剪功底的作用分不開的。我們盆景流派甚多，風格各異，在樁景技術修剪技法上也各有千秋。
藝術剪枝
樹樁盆景剪枝四法
藝術剪枝是要賦予樁景以生命和靈魂，達到景有盡而元窮的境地，追求的是樁景意境的深遠，因樹枝是樁景表達神韻和深遠意境主要的對象，因而它的剪枝技法更注重于樁景整體的結構。它嚴謹的結構表現在樹枝的疏密、聚散、藏露、曲直、顧盼等藝術造型手法上。樹枝的神韻應以蒼勁、飄逸、動感來加以豐富形象的特征。從而產生意境，使作品達到形神兼備、情景交融的藝術效果。
藝術剪枝在某種程度上說又有很大的隨意性，它可不受任何形式的束縛而“隨心所欲不逾矩”地剪截，但萬變不離其宗。總之盆景的終目的和其它藝術品一樣，是要讓觀眾在感性的具體藝術形象中得到思想的啟發、情感的陶冶和美的享受，這也是一切真正的好的藝術作品所必須具有的基本特點。
控制剪枝
控制剪枝是對成型后的樁景景觀的維持和再創作，這是一項十分重要而長期、繁雜的工作，它由抹芽、摘心、疏枝和截枝而組成。
1、抹芽：抹去那些沒有前途的不定芽，讓樁景健康生長。其實這也屬于科學剪枝范圍。
2、摘心：不僅能抑制枝條的過快生長，而且在一定時間之內還能保護樁景原有的美感，是很好的抑制變型的措施。
3、疏枝：是針對樁景長期生長從而主枝分枝增多、密度過大，造成不透風、光照條件差，所產生的葉子發黃和病蟲害的現象，有礙觀賞而采取的一項措施。這也屬于科學剪枝范圍。
4、截枝：定型后的樁景經過長期的生長，因枝條的粗度和長度，已不能保持樹姿的原有景觀，便通過剪截、疏剪和其他的剪枝措施加以控制。這也是一個再創作過程，具體實施可將每組枝條縮短至一定比例（這一比例的標準是新生枝條容易生長到所剪枝條的粗度），不造成脫節現象。剪截不僅可使植物得到生理平衡，也可使某些不理想枝條重新得到改造，以至產生更佳的觀賞效果。應注意的是：有些樹種萌芽力強，有些樹種萌芽力弱；還有開花、結果的，要有針對性地剪截。避免使嘔心瀝血的作品造成不必要的損失。