大蔥葉枯病是大蔥常見的病害之一，主要危害葉片和花莖。病原是枯葉格孢腔菌，以菌絲體戓子囊殼潛藏在病殘體于土中越冬，第二年在條件適宜時，散發子囊孢子侵染，分生孢子隨氣流傳播，為弱寄生菌，不易侵染健株，且經常伴隨著霜霉病和紫斑病發生。
當葉尖染病時，初期會出現褪綠色伴小色斑，后擴大為淡綠色橢圓形小斑點，大小不一，密生黑色霉狀物。后期嚴重時，病斑產生小黑點，引起葉片卷曲，枯死。花梗染病，病斑圍繞花莖，呈紡錘形，黑褐色，并且有同心輪紋。發病嚴重時，易從病部折斷，植株不能抽薹。
目前來說，防治方法主要有農業防治法和農藥防治法。農業防治主要有前茬作物殘留、田間雜草、殘株、落葉等，消滅病原；增施有機肥，加強田間管理，合理密植，提高植株抗病力，雨后排水，降低田間濕度等。
農藥防治方面，在發病初期，可選用70%代森錳鋅可濕性粉劑500倍液，或40%丹可濕性粉劑400倍液，或50%異菌脲可濕性粉劑1500倍液，或58%甲霜錳鋅可濕性粉劑500倍液，或75%百菌清可濕性粉劑600倍液，毎7—10天1次，噴3—4次。