二氯喹啉酸是防治稻田稗草的理想選擇性除草劑。水稻的根部能將二氯喹啉酸分解，因而對水稻相對。但有些農戶沒有掌握使用技術，以致近年各地使用該除草劑造成藥害的現象時有發生。
水稻秧田
在水稻秧田，特別是旱育秧田，使用二氯喹啉酸除稗，不少地方發生了藥害現象，***常見的癥狀是出現秧苗心葉卷曲，心葉像針一樣直立生長，以后多會枯死，即使成活，所形成的分蘗苗也是畸形的。藥害輕的秧苗，莖基部膨大、變硬、變脆，心葉變窄并扭曲成畸形，以后長出的分蘗苗仍能正常生長，藥害癥狀一般在施藥后10~15天出現。秧田使用該除草劑除稗，施用過早容易發生藥害，一般要求在水稻秧苗2葉1心期使用，而且每畝純藥量不宜超過25克，同時應注意均勻施藥。如果在秧苗生長期遇到較長時間的陰雨、低溫天氣，秧苗素質差，或者秧苗根系生長不良，能力下降，更容易造成秧田的藥害發生。
直播稻田
直播稻田在播后苗前別施用二氯喹啉酸除草，這是因為在水稻二葉期前施用，容易產生藥害，表現為水稻分蘗期葉片披散，不分蘗，并產生筒狀葉，特別是在水稻1葉1心期前，稻苗接觸到少量的二氯喹啉酸就會發生藥害。另外，該藥很少被土壤吸附，在土中的移動性較強，并具有較長的持效期。因此，在水稻播后苗前使用該除草劑，水稻出苗過程中的幼芽接觸到稻田土壤中的時，便會顯示藥害癥狀。主要表現為水稻發芽、出苗、生長遲緩、苗前芽鞘彎曲，出苗后芽鞘變褐早枯，莖葉彎曲、扭卷，導致直播稻幼苗矮縮，根系短小并顯著減少。在直播稻田，有時因出苗率不高需要直播補種時，也應注意，凡是已噴過二氯喹啉酸的直播田，也不能直播稻種進行補種，否則同樣會產生藥害癥狀。
機插稻田
在機插稻田，一些地方用二氯喹啉酸防治4葉期以上的大齡稗草時，隨意加大該除草劑的施用量，一般用50%二氯喹啉酸可濕性粉劑在50克左右。增加用藥量以后，使二氯喹啉酸藥害風險加大，也應該引起高度注意。***好采用稻杰、千金等性較高的莖葉處理劑，而不使用二氯喹啉酸，以避免或減輕藥害發生。
藥害解除
水稻發生二氯喹啉酸藥害后，受害輕時一般能自行恢復，適當增施肥料促長恢復。發生較重時，可用30毫克/升赤霉素加適量腐殖酸鹽葉面噴施。也可以使用碧護0.136%蕓苔·吲乙·赤霉酸可濕性粉劑噴施，解除水稻二氯喹啉酸藥害有較好的效果，藥害輕的田塊每畝用藥3克加水30公斤噴霧，5天左右秧苗即可基本恢復正常。藥害較重的田塊，在***次施藥后5~7天再噴1次藥，也能收到良好的解害效果。
嚴控殘留
二氯喹啉酸在土壤中有較大的移動性，能被土壤中微生物分解，在土壤中的殘效期長，容易對多種后茬敏感作物產生殘留藥害。據資料介紹，西瓜、甜瓜、南瓜、葫蘆等作物對二氯喹啉酸除草劑敏感，特別是在水田改土后種植瓜類等敏感作物時，如果稻田除稗施用該除草劑藥量超標，很多后茬作物受藥害現象比較普遍，使后茬種植的西瓜生長出現受到抑制、葉色暗綠、根少、葉片皺縮的癥狀。因此，在稻田改作旱土種植西瓜等瓜類作物時，應注意稻田施用二氯喹啉酸的劑量（一般每畝不能超過50克），并注意增加細水噴霧，盡量減少在稻田土壤中的殘留量，防止對后茬作物造成藥害。