冬天溫度低，番茄果實膨大定型需要的時間長，轉色速度較慢，在管理上也會出現很多問題，因此要特別注意。
1、減少水肥供應
冬季陰雨天氣較多，通常大棚內不光溫度低，而且濕度也相對比較大，所以遇到這種情況。在施肥和澆水時，就應該相應的減少一些，或者不澆水、不施肥，延長原有肥水的使用時間，防止病害高，加重病蟲害。
2、防治病害
冬季大棚內低溫高濕的環境，很容易引發番茄的灰霉病或者霜霉病。而在發生病害時，多數種植戶會去打農藥，但在此條件下，打過農藥之后，葉片不能吸收，很可能還會加重病害。正確的做法應該是用糖加尿素再加上磷酸二氫鉀進行噴施。一般一噴霧器要用70克糖、45克尿素以及40-50克磷酸二氫鉀，通過葉片每隔5-7天噴灑一次。
3、植株調整
在冬季大棚番茄管理的過程中，若發現番茄植株長出一穗果，可將一穗果下方的多余側枝摘除，讓營養供應到果實上，促進果實生長膨大。另外，適當打杈進行植株調整，打杈時間建議選擇在上午10-12時進行，晴天為宜。
但若番茄掛到4–5穗果已經定型時，為了每一個側枝上的果實生長均勻，則要將小型果或者畸形果摘除，可有效提高番茄的商品性。
4、棚內增溫
冬季連續低溫，尤其是北方可能還會伴有雨雪天氣，這無疑會對棚內番茄的生長造成嚴重的影響，因此進行棚內增溫操作非常關鍵。建議可用增溫塊或者大棚上蓋棉被等方法，減少放風的同時適當通風。