肥料相克是個很重要的問題，引起很多專家的注意，盡可能做到平衡施肥。對農作物偏施或多施單質肥料，不僅浪費了肥料，增加了生產成本，而且導致其他某種或某些營養元素的缺乏。施肥時，要根據農作物需肥結構的不同和土壤的供肥能力，做到量出為入，不偏不少，力求營養元素之間的平衡，這樣就可以相安無事。
另外，還要根據不同作物對各種營養元素的需求比例關系，要增同增，要減同減。相對單質肥料而言，復合肥或復混肥營養元素的比例關系比較適當和協調。因此，施肥時應以復合肥為主，以單質肥料為輔，如對于以塊莖、塊根為收獲對象的蔬菜等需鉀量大的農作物，可在施用硫基復合肥的基礎上，再適當增加硫酸鉀單質肥料作補充。
錯開施用時期或施用部位。鋅肥和磷肥若混施，必然會產生“相克”.因此磷肥應作底肥或基肥施用，鋅肥應作追肥施用。氮、磷、鉀等大量元素肥料應以根際追肥為主，微肥應采取葉面噴施的方法。
縮小接觸范圍。氮、鉀肥可采用撒施的方法；磷肥可采用集中施肥的方法；微肥可采用拌種、浸種、蘸根等方法，使微量元素局限在根部這一較小的范圍內，盡量不與大量元素接觸。