用藥時機把握不準。打藥務必抓住時機，只有了解病蟲所發生的規律，適時用藥，方能秦效。
施法不當。田間病蟲的發生、危害和棲息在作物上都有一個危害部位，這特定的部位，便是農藥應該射中的靶。射不中靶，農藥防效就差。
病蟲抗性不斷增加。病菌和害蟲對農藥的抗性，是當今阻礙農藥發揮應有防治效果和潛在效能的現實問題。 不懂技術，防治對象不明確。病當蟲打，蟲當病殺，草做蟲除，這首先是診斷錯誤，判別不清，導致錯誤用藥，防治不佳甚至產生藥害。
噴施藥液浪費大。目前農村普遍使用的噴藥器具，費勞力、浪費大、霧粒粗、防效差。這種噴霧器噴出的霧粒，粘著性差，沉積率低，藥液滴落在土壤里，流失在水域中，不但白白浪費了藥液，而且嚴重地污染了環境。
農藥自身防效的局限。有些農藥對某些病蟲有良好的防治效果，但對另一些病蟲卻無能為力，防效極差。