大量元素中，碳、氮、氧可從空氣和水中取得，一般可以滿足需要。中藥材需要氮、磷、鉀的量較大，它們被稱為肥料三要素，往往需要通過施肥來補充。微量元素因為植物需要量很少，一般土壤都能滿足需要，只有少數土壤需要補施。那么，中藥材需要哪些微量元素？
1.氮 氮是構成蛋白質的主要成分，而蛋白質又是細胞原生質的重要組成部分，也是與植物新陳代謝有關的酶、維生素、葉綠素及核酸等不可缺少的成分。氮對植物體內生物堿，甙類和維生素等，特別是生物堿的形成與積累起著重要作用。氮素缺乏將影響藥材的品質。但過多時蛋白質含量增加，碳水化合物含量降低，碳、氮比例失調容易造成莖葉徒長，發生倒伏，降低抗病蟲害的能力。對全草類和葉類，特別是含生物堿類，如顛茄、藿香等適當增施氮肥，能獲得較高的產量和質量。
2.磷 磷是核酸、和磷脂的主要組成成分。磷能促進植物的生長發育，縮短生育期，提早開花結果，提高果實和種子的產量和品質，增強植物的抗寒、抗旱和抗病蟲害能力。植物缺磷時，代謝作用受到抑制，葉片瘦小，呈暗綠色，缺乏光澤；嚴重時葉邊緣呈紅紫色或銅青色斑點，植物生長發育遲緩，產量低，質量差。對于五味子、沙苑子、決明等果實、種子類藥用植物，增施磷肥可提高種子的產量和品質，特別是種子田增施磷肥，能使種子積累多量，有利苗期生長。
3.鉀 鉀直接參與植物的代謝過程，絕大部分存在于植物細胞液中，少量被吸附在原生質表面，微量呈不可代換態存在于原生質的線粒體中。鉀能提高光合作用的強度、增進碳水化合物的合成、運轉和貯藏；鉀還能增強氣孔的正常生理功能，促進氮的吸收，強化蛋白酶的活性，加速蛋白質的合成；對于含淀粉、糖、蛋白質較多的，增施鉀肥能提高產量和改善品質；鉀還能促進維管束的發育，使厚角組織增厚，韌皮束變粗，使莖干堅韌，抗倒伏，抗病蟲害。此外，鉀還能提高植物的抗逆性，提高抗寒和抗旱能力。對人參、黨參、黃連、西洋參等根類藥用植物增施鉀肥可提高藥材產量和質量。
4.硼 硼能促進植物體內碳水化合物的運轉，改善糖類代謝，促進有機質的積累。同時，硼還能增強根瘤菌的固氮能力，促進根系發育。缺硼時，根系發育不良，根瘤菌固氮能力降低，花的受精率降低。
5.鉬 鉬與生物固氮作用有密切關系，根瘤菌和自生固氮過程中均需微量的鉬。鉬又是硝酸還原酶的成分，能促進植物體內硝態氮還原為銨態氮。
6.鋅 鋅能促進植物體內氧化還原過程，促進呼吸作用和生長素的形成。缺鋅時，由于抑制去氫酶的活性，影響碳酸酐酶的組成和生長素的形成，使呼吸作用減弱，生長受到抑制。
7.銅 銅是植物體內氧化酶的組成成分，能提高呼吸強度，有利于光合作用，并能增強抗病害的能力。缺銅時葉綠素減少，發生缺綠病。
8.錳 錳也是植物體內許多氧化酶的成分，它對氧化還原過程起著重要作用，并能促進種子萌發，幼苗生長及生殖器官發育，能促進葉綠素的形成，以利光合作用。同時錳還可以提高植物越冬性，及抗倒伏能力。缺錳時葉脈失綠，并出現斑點。
9.鐵 鐵是形成葉綠素的必需元素，缺鐵時嫩葉表面呈現失綠癥狀。