小麥優良品種有時候會在使用時出現混雜退化的現象，品質變差，抗逆性下降，那么，怎樣防止小麥品種混雜退化？
一是機械混雜在小麥播種、收藏、脫粒、曬種、運輸及貯藏過程中，出現人為的混雜，這是目前小麥品種混雜的重要原因之一。
二是生物學混雜在田間不同品種間出現天然雜交，引致后代分離，而出現不良個體，破壞品種的一致性，叫做生物學混雜。當機械混雜嚴重時，更會加重生物學混雜，加快品種退化速度。
三是突變小麥新品種在推廣時，由于各種自然因素的作用，導致小麥產生某些突變，出現突變個性，生產上突破個體的性狀多是變差。
四是小麥品種本身繼續分離有些雜交育成的小麥新品種性狀不太穩定，基因型純合度不高，這些新品種在種植過程中就會繼續分離，產生變異個體，造成品種變雜退化。五是選留種質量不高生產過程中未按本品種典型性狀選留種。
根據小麥品種混雜退化的原因，有關專家總結出一套可有效防止小麥品種混雜退化的方法，具體如下：
（1）嚴防機械混雜收獲小麥種子時必要做到單收、單運、單晾和單獨貯藏。種子貯藏過程中要防蟲、防鼠、防霉。對種子進行晾曬、處理及播處時，工具要清掃干凈。
（2）防止生物學混雜在小麥良種繁育過程中，注意采取必要的隔離措施，嚴防生物學混雜。如進行必要的空間隔離，即種植不同的小麥品種要間隔一定距離；時間隔離采用錯開播種期播種，使不同小麥品種的開花期錯開；也可采用屏障隔離法通過高稈作物、樹林等屏障，使不同品種的花粉不能傳到小麥制種田。
（3）選留種時，嚴格去雜去劣。特別注意去掉不符合本品種典型性狀的植株或麥穗、麥粒，即去雜；去劣是指去掉被病蟲害污染的穗粒和生長不良的植株。
小麥的防雜保純工作是一項復雜的系統工程，必須抓好種源供應、基地建設、去雜去劣、種子檢驗、加工營銷等每一個關鍵環節，應該嚴格執行國家規定的小麥原種及良種質量標準，程度地降低小麥品種混雜退化的機會，能夠確保種子的純度和質量。