草菇是一種喜溫、喜濕的草腐生菌，栽培技術易掌握，生產成本低，是食用菌中收益快的一種。但草菇播種后，在其生長過程中，往往會出現一些異常現象，既影響產量又影響品質。
一、菌絲萎縮
一般情況下，草菇播種后12小時左右菌種塊就開始萌發，并不斷向料內生長。如果播種后24小時菌絲仍未萌發或仍不向料內生長，就可能是發生了菌絲萎縮。
菌絲萎縮的原因：
①高溫燒菌。當培養料內的溫度長時間超過45℃時，就會使菌絲萎縮死亡。
②影響。草菇對農藥十分敏感，播種后，有的菇農為了防病殺蟲會噴灑農藥，致使菌絲因藥害而萎縮。
③缺氧窒息。培養料含水量過高（超過70%）或塑料薄膜覆蓋過嚴，使草菇菌絲因缺氧窒息而萎縮。
④氨氣危害。培養料內的尿素添加過量或田內化肥含量過高，揮發出來的氨氣散發不了，對草菇菌絲造成危害。
⑤菌種低劣。菌種的菌齡太短或太長，生活力弱，抗逆性差，在環境條件不適宜的情況下發生萎縮。
⑥溫差過大。草菇的菌絲對溫差較敏感，如白天氣溫在32℃以上，夜間溫度在28℃以下，噴水后即會發生菌絲萎縮。
⑦發生蟲害。培養料中出現害蟲，由于害蟲的咬食，致使菌絲萎縮。
菌絲萎縮的預防：草菇的生長周期短，發現菌絲萎縮時，應及時找出原因，采取有效措施，并補種新種，以減少不必要的損失。具體措施有：
①防止溫度過高。露地陽畦栽培時，搭簡易的遮陽棚，防止中午高溫時燒壞菌絲。堆制培養料的過程中，料溫達到75℃左右時，翻堆兩次。進床時鋪料的厚度視季節而定，早春及晚秋溫室栽培時鋪料宜厚一些。
②不用農藥。防治病蟲要在處理原料時就辦妥，播種后不能再向料面施藥。
③水分要適當。播種時培養料的含水量62%左右，以用手緊握料有1～2滴水珠從指縫中滲出為度。在培養料水分及氣溫偏高的情況下，應將覆蓋在料面上的薄膜撐起些，以利通氣。
④預防氨害。尿素的添加量不能超過0.2%，而且要在堆料時加入。
⑤選用優質菌種。草菇菌種以菌齡在15～20天，菌絲分布均勻，生長旺盛整齊，菌絲灰白有光澤，有紅褐色厚垣孢子，無雜菌、無蟲螨為好。菌齡超過1個月的菌種不宜使用。
⑥依溫度用水。培養料的調水，要根據當時的氣溫靈活掌握，噴水的水溫要與氣溫基本一致。
⑦搞好環境衛生，注意防蟲。栽培場地要遠離畜禽圈舍，材料要干凈無霉變，用前暴曬2～3天。菇房消毒，以杜絕蟲源。
二、菌絲徒長
在發菌階段，當料面出現大量白色絨毛狀氣生菌絲時即為菌絲徒長。菌絲徒長后，不能及時轉入生殖生長，現蕾推遲，成菇少，產量低。
菌絲徒長原因多由于通氣不良致使料床內溫度高、濕度大、二氧化碳濃度高，刺激了菌絲徒長。
菌絲徒長的預防料面覆蓋塑料薄膜，2～3天后根據菌絲生長情況，白天定期揭膜，以適當通氣和降溫、降濕，促使草菇菌絲往料內生長。