小麥莖基腐病是一種由假禾谷鐮孢菌、禾谷鐮孢等真菌引起的土傳病害，在小麥全生育期均可發生，發病田一般造成減產5%-10%，重發田達50%以上，甚至造成絕收！那么小麥莖基腐病怎么治呢？小麥莖基腐病有效防治方法！
1、農業防治
一是深耕整地。玉米收獲后及時進行粉碎還田，結合深耕（耕深25cm以上），耕后細耙、鎮壓，踏實土壤。示范顯示深耕能夠減少土壤表層病殘體含量，明顯降低發病程度。如2014—2015年度在新鄉縣小冀鎮杏莊村鐵路西河灌區300hm2示范，據調查沒有死苗和白穗現象，較上年增產小麥250t，增加效益640萬元。
二是種植有耐性的品種。重病田應重點選擇半冬性、矮稈耐病、抗倒春寒的品種，如百農207、百農607、鄭麥136等。
四是適時晚播。根據小麥品種特性，選擇適宜播期，半冬性品種播期10月10—23日，弱春性品種播期10月15—25日，播種量以10—12.5kg/畝為宜，同時避免大播量而造成個體發育較弱的現象，提高抗病性。
五是合理施肥。實行配方施肥，合理使用氮、磷、鉀肥，增施鋅肥；使用充分腐熟的有機肥。促進麥苗健壯生長，增強植株抗病能力。
六是健身管理。推廣節水灌溉，降低土壤濕度；小麥苗期及時防治麥蚜、麥蜘蛛，減少害蟲為害造成的傷口；入冬前及時冬灌，預防凍害；中后期結合防治病蟲害噴灑葉面肥，促進小麥健壯生長，增強抗病能力。
2、化學防治
一、種子處理藥劑
1.在小麥莖基腐病防治上已登記的種子處理藥劑：咯菌腈·噻蟲胺（須為取得農藥登記等相關許可證件的產品）；
2.在小麥其他病害防治上已登記的種子處理藥劑：苯醚甲環唑·咯菌腈·噻蟲嗪、戊唑醇·吡蟲啉、咯菌腈·嘧菌酯、苯醚甲環唑·咯菌腈、氰烯菌酯·戊唑醇、苯醚甲環唑、吡唑醚菌酯、戊唑醇（須為取得農藥登記等相關許可證件的產品）；
3.尚未在小麥上登記的種子處理藥劑：種菌唑、三氟吡啶胺（須為取得農藥登記等相關許可證件的產品，在當地農業農村部門試驗示范、技術指導下使用）。
二、苗期噴施藥劑
丙硫菌唑、丙硫唑、丙環唑、吡唑醚菌酯、葉菌唑、氰烯菌酯、戊唑醇、苯醚甲環唑、氯氟醚菌唑等在小麥上登記的單劑及其復配制劑。