玉米炭疽病一旦發生，影響較大，要想使該病得到有效地防治，可使用農業防治和生物防治。
農業防治
1、選用墾粘2號、渝糯1號、西玉7號、白粘早玉米、黃粘早玉米等優良品種。
2、實行3年以上輪作，深翻土壤，及時中耕，提高地溫。
3、施用日本酵素菌漚制的堆肥或腐熟有機肥。
4、播種或移栽前，田間及四周雜草，集中燒毀或漚肥；深翻地滅茬，促使病殘體分解，減少病原和蟲原。
5、和非本科作物輪作，水旱輪作。
6、選用抗病品種，選用無病、包衣的種子，如未包衣則種子須用拌種劑或浸種劑。
7、育苗移栽或播種后用藥土覆蓋，移栽前噴施一次除蟲劑，這是防病的關鍵。
8、適時早播，早移栽、早間苗、早培土、早施肥，及時中耕培土，培育壯苗。
9、選用排灌方便的田塊，開好排水溝，降低地下水位，達到雨停無積水；大雨過后及時清理溝系，防止濕氣滯留，降低田間濕度，這是防病的重要措施。
11、土壤病菌多或地下害蟲嚴重的田塊，在播種前撒施或穴施殺蟲的藥土，
12、施用酵素菌漚制的堆肥或腐熟的有機肥，不用帶菌肥料；采用配方施肥技術，適當增施磷鉀肥，加強田間管理，培育壯苗，增強植株抗病力，有利于減輕病害
13、地膜覆蓋栽培；合理密植，及時摘除莖部處2-3片葉子，增加田間通風透光度；及時病株、老葉，集中燒毀，病穴施藥。
14、及時噴施除蟲藥，防治好蚜蟲、灰飛虱、玉米螟及地下害蟲，斷絕蟲害傳毒、傳菌途徑；防止病菌、病毒從害蟲傷害的傷口進入而危害植株。
15、高溫干旱時應經常灌水，以提高田間濕度，減輕蚜蟲、灰飛虱危害與傳毒。嚴禁連續灌水和大水漫灌。
16、適當調節播種期，盡可能使該病發生的高峰期，即玉米孕穗至抽穗期，不要與雨季相遇。
生物防治
浸種劑
80%抗菌劑402水劑5000倍液浸種24小時后，撈出晾干即可播種。發病時噴施
2億活芽孢/ml假單胞桿菌水劑（葉扶力）500~800倍液。
80%抗菌劑402水劑8000倍液。
化學防治
拌種劑
用種子重量用種子0.2%的10%二硫氰基甲烷（浸種靈）拌種，堆悶24~48小時后播種。
用種子重量0.7%的50%萎銹靈或50%敵克松或40%拌種雙或50%多菌靈拌種。
用5%根保種衣劑拌種，拌種方法：先把藥劑加適量水噴在種子上拌勻，再堆悶4~8小時后直接播種。
噴施用藥
50%甲基硫菌靈可濕性粉劑800倍液。
50%苯菌靈可濕性粉劑1500倍液。
25%炭特靈可濕性粉劑500倍液。
80%炭疽福美可濕性粉劑800倍液。