大棚土壤消毒劑是對病原菌進行作用，從而起到殺菌防病的目的。大棚蔬菜生長時用到土壤消毒劑的情況有很多，這主要是因為大棚蔬菜重茬現象頻繁，這樣很多土傳染病害就會嚴重，下面我們以前來看一下三種主要的大棚土壤消毒劑。
第一：溴甲烷。溴甲烷使用前要先清除蔬菜殘存秸稈和根系，深翻土壤至少30厘米，施好底肥，打碎大土塊，保證土壤20厘米深處溫度至少在8度以上，溫度越高，熏蒸作用越強。處理時搭小拱棚，棚膜要蓋嚴。一般每畝用藥40公斤，每13平方米放1罐藥，藥罐下墊一小塊塑料布，施藥時將藥罐卡于開罐器上，隔著覆蓋的棚膜，用力向下壓罐，使開罐器的尖刃刺破罐，溴甲烷呈液態瀉出于下墊的塑料布上，幾分鐘后氣化。使用溴甲烷一定要謹慎，通風期間嚴禁農事操作，熏蒸期要達到15天左右，揭開薄膜通風30天以上才可種植。由于溴甲烷對病菌、雜草、線蟲、昆蟲和螨類等均有效，并且使用溴甲烷對黃瓜、番茄有明顯的增產效果，受到很多農戶的歡迎。
第二：氰氨化鈣。使用這種土壤殺毒劑時，一般先將土雜糞撒入棚中，用旋耕機旋耕后將氰氨化鈣均勻撒施在棚地上，然后再用旋耕機打勻，覆蓋地膜，20-25天后揭膜。
第三：棉隆。這是一種低毒的土壤消毒劑，與氰氨化鈣和溴甲烷相比較來說安全性更高。棉隆濕度比較高的土壤中會產生異硫氰酸甲酯氣體，這種氣體會迅速擴散至土壤顆粒間，可以有效殺滅土壤中各種線蟲、病菌、地下害蟲及雜草種子，從而達到清潔土壤、疏松活化土壤的效果。使用方法：土壤施好底肥后深翻約30厘米，然后整平，澆水保濕3-4天，等到手可以把土壤捏能成團，1米高掉地后能散開的時候，用旋耕機旋耕。然后將棉隆均勻撒在地表，每畝用藥20-30公斤，施藥后立即用塑料布覆蓋。棉隆分解產生的氣體比空氣輕，特別要注意，一定要確保塑料布沒有破損，不能用地膜等太薄的塑料布，且四邊用土壓實，密封好。密封期保證在12天以上，結束后揭去塑料布，通風一周后取土做發芽試驗，確保安全后才可進行育苗。
在此特意提醒：土壤經過處理后也殺滅了土壤中的有益菌，應及時補施生物菌肥，以保證土壤中有足夠的有益菌存在，如果是用消毒劑熏蒸過的棚室，在施用菌肥前應先敞棚透氣10天以上。