玉米莖基腐病使用多種病原菌單獨或復合侵染造成根系和莖基部腐爛的一種土傳病害，其中種子可攜帶珠串鐮刀菌的分生孢子。由于近年來耕作制度的改變和人們對其重視不足，造成其發病程度越來越嚴重，嚴重影響了玉米的高產穩產。
那么該怎樣防治玉米莖基腐病呢？
一是進行田間輪作。實行玉米各種各樣的非寄主作物輪作，防止土壤的病原菌繼續不間斷積累。發病嚴重的土地可與水稻、馬鈴薯、蔬菜作物實行2-3年輪作。
二是適當晚播。北方種植春玉米的地方，是在4月下旬到5月上旬之間播種，這個時間播種能有效的防治莖基腐病的發生；在5月下旬到6月上旬的時候套種玉米能讓莖基腐病發病減輕。夏玉米在6月15日左右播種，能減輕莖基腐病發病率。
三是施肥要合理。據實地考驗之后，有非常準確的數據可供參考，每667平方米在播種的時候施用種肥復合肥15-20公斤，在玉米10葉期的時候，再配以硫酸鉀20公斤、尿素20公斤和硫酸鋅1.5公斤施用，讓麥秸稈加速腐爛，促進玉米的健康生長，增強玉米的抗病能力。
四是拌種用藥劑。可以在玉米種植之前有藥劑拌種，能在根源上提高玉米的抵抗能力，減輕莖腐基病的發病率。
五是用藥劑噴霧。在玉米7葉之前，用苯醚甲環唑或者是烯酰嗎啉兌水稀釋，在對玉米進行噴霧，也可以減輕玉米莖腐基病害。