蘋果套袋后，還需要加強套袋后的管理，這對產生優質蘋果至關重要。蘋果套袋后果實進入膨大期，這是果實發育的重要時期。此時的管理及病蟲害防治對于果樹的品質提高具有重要意義。
土壤管理
蘋果套袋后應適逢雨天對土壤進行深翻熟化，這樣在改良土壤的基礎上，又增加了土壤的透氣性，同時還能擴大根系的分布范圍。張明科說，土壤深翻的深度，一般以80~100厘米為宜，采取逐年、隔行深翻的辦法進行，可有效防止一次深翻傷根過多的問題；與此同時，要做好果園覆草工作，這樣有利于吸收根的產生和發育，具有明顯的抗旱效果。覆蓋的厚度通常為15~20厘米，覆蓋可以農作物秸稈、雜草、樹葉等為原料，進行就地取材。
合理施肥
張明科表示，套袋后的果園無論在施肥量、施肥種類、施肥方案、施肥方法等環節中都有別于無袋栽培的蘋果園，相比之下，套袋后的施肥量要大于套袋前，另外應加大微量元素肥料的施用量。選擇施何種類型的肥料要根據樹體的長勢，以及產果量的多少而定，一般應做到配方施肥，控制氮磷鉀的比例在2∶1∶1為宜。在施基肥時，時間一般掌控在早秋時節施入為好，盛果期樹一般1公斤果需施2公斤有機肥的標準進行。催果肥，以復合肥為宜；另外，要做好葉面噴肥工作，選擇噴布磷酸二氫鉀、稀土、增糖劑等，提高套袋果的含糖量，促進果實著色。
適當灌水
“套完袋后，應及時澆一次透水，防止發生日灼現象。”張明科說，夏季應根據土壤干旱狀況靈活掌握，做到“隨旱隨灌”。張明科還提醒，在灌水時要注意以下幾個時期：在花芽分化臨界期，應控制灌水，以便促進花芽分化；果實采收前禁止灌水，以提高果實含糖量和促進果實著色；果園秋季高溫干旱時，為防止果實發生日灼病，可在套袋果摘袋前灌一次水。
病蟲害防治
套袋后至采收，要重點防治早期落葉病、輪紋病、紅蜘蛛、蚜蟲等病蟲害的發生，同時注意防治因套袋而引起的特殊病蟲害，如苦痘病、康氏粉蚧等。張明科表示，蘋果在摘袋后至采收前，應及時噴施殺菌劑，以防止爛果病發生，避免使用波爾多液，以免污染果面，影響果品質量。早期落葉病用70%的甲基硫菌靈800倍液；輪紋病用25%的炭特靈600倍液；紅蜘蛛用15%的掃螨凈2500倍液；蚜蟲用10%的吡蟲啉2500倍液。苦痘病在花后或除袋前噴布0.3%的硝酸鈣進行補鈣；在套袋前打藥時，要加上10%的吡蟲啉3000倍液，防止康氏粉蚧發生。
摘袋后果實的管理
“適時進行秋剪，要樹冠內徒長枝，疏間外圍競爭枝，以及骨干枝背上的直立旺梢，從而改善樹冠內光照條件。”張明科說，同時并摘除果實附近影響果實著色的葉片，摘袋后十天左右，要轉果一次，使果實的陰面也能獲得陽光直射而使果面全面著色。另外，應在采收前一個月左右的時間噴布萘乙酸和0.2%的B9，可防止落果并促進果實著色。摘袋后補噴1次氨基酸鈣，以防止苦痘病的發生。