國家生物農藥工程技術研究中心是2011年由科技部批準設立的有關生物農藥研究的工程技術中心。中心依托湖北省農業科學院組建，以院二級獨立法人單位湖北省生物農藥工程研究中心為主體，整合院農業質量標準與檢測技術研究所分析測試研究室、植保與土肥研究所農作物重大病蟲草害防控湖北省重點實驗室以及經濟作物研究所蔬菜研究所的部分相關專業技術人員、資源組成，中心現有固定人員79人，其中科研人員49人，生產經營人員17人，管理人員8人；博士27人，碩士13人；具有高級職稱人員39人，國家“百千萬人才工程”和省新世紀高層次人才6人。

中心設綜合管理辦公室、計劃財務部、研究開發部、成果轉化與推廣部及中試基地；研究開發部包括新藥篩選研究室、生物催化與轉化研究室、綠色化學與合成研究室、制劑技術研究室、工程技術研究室5個研究室。目前中心已建成13169 M2的微生物資源挖掘與利用平臺，在建17285 M2的中試與驗證平臺、2705 M2的智能溫室評價平臺及200畝立體種養微生物循環農業試驗示范基地。其中多功能中試和驗證平臺擁有不同規格發酵罐，包括50升18個、200升4個、500升2個、1噸3個、5噸2個、10噸6個和100噸6個，擁有6×100M3規模的驗證服務生產線，并配套完善的微生物活菌制劑、蛋白質與酶制劑、農用與小分子代謝產物后處理工藝裝備，將成為國內完備的農用微生物產品中試與成果熟化轉化開放服務平臺。

國家生物農藥工程技術研究中心以服務生物農藥行業為核心，以成果轉化及生物農藥研究開發為重點，針對生物農藥行業的重大關鍵性、基礎性及共性問題，開展生物農藥工程化技術開發、產業化關鍵技術研究及生物農藥資源的開發。中心致力于打造同國際接軌的微生物技術綜合鏈式服務大平臺，服務院所高效、生物企業、綠色及有機農產品基地，共同推動我國食品以及農業的可持續發展。