吉林省農業科學院是以應用研究、應用基礎研究和開發研究為主的綜合性農業科研機構。其前身是1913年建立的日本南滿鐵道株式會社公主嶺農事試驗場；1938年改稱滿洲國立公主嶺農事試驗場；1946年國民黨政府接管，改名農林部東北農事試驗場；1948年東北解放，建立了東北行政委員會農業部公主嶺農事試驗場；1950年改為東北農林部農業科學研究所；1953年改稱東北行政委員會農業局東北農業科學研究所；1954年為農業部東北農業科學研究所；1958年改為中國農業科學院東北農業科學研究所；1959年，成立吉林省農業科學院。2004年吉林省政府和中國農科院依托吉林省農業科學院共建“中國農業科技東北創新中心”，與吉林省農業科學院合署辦公。
全院內設12個處室、12個研究機構、1 個農業信息服務及技術推廣機構，1個農場、2個綜合試驗站。此外，主管一所大專學校——吉林農業工程職業技術學院，有13個關聯企業。其中，院機關和大豆研究中心、生物技術研究中心、農業環境與資源研究中心、農產品加工研究中心、農業經濟與信息服務中心5個單位設在長春院區；畜牧科學分院（下設畜牧研究所、草地研究所、動物營養研究所）、玉米研究所、水稻研究所、植物保護研究所、作物育種研究所、果樹研究所、經濟植物研究所（范家屯）、農村能源研究所10個研究所，良種繁育實驗場以及主要試驗地在公主嶺院區；2個試驗站分別是范家屯綜合試驗站、洮南綜合試驗站。
全院共設229個學科，其中一級學科54個，二級學科175個。承建國家和省非獨立科研機構、基地、中心、實驗室37個。
全院現有職工1272人（不包括關聯企業和主管單位），科技人員879人，其中高級研究人員316人。全院在聘二級研究員10人，三級研究員32人，四級研究員26人，副研究員214人。全院共有博士98人，碩士253人，在站博士后19人；有博士生導師5人，碩士生導師36人。
全院有新世紀“百千萬人才工程”人選 3 人、特殊津貼享受者 17人、吉林省高級專家 18人、獲得吉林省科技進步特殊貢獻獎2人（全省僅4人）、省有突出貢獻的中青年專業技術人才26人、省拔尖創新人才25人。
吉林省農科院占地總面積891.8公頃，其中公主嶺院區占地面積545公頃，長春院區占地面積16.8公頃，洮南試驗站占地300公頃，范家屯試驗站占地30公頃。總建筑面積近13萬平方米，其中長春院區建筑面積5.1萬平方米。
吉林省農業科學院擁有雄厚的科技資源。擁有儀器設備3402臺（件），其中1萬元以上大型儀器設備1122臺（件）。收集保存玉米、大豆、水稻、高粱、小麥、谷子、雜豆、果樹、苜蓿等各類植物種質資源2.8萬份。其中大豆種質資源? 10640份，玉米種質資源8000份。收藏科技文獻30萬余冊，各種珍貴檔案資料4萬余卷。編輯出版《玉米科學》、《吉林農業科學》、《農業科技管理》、《牧草與飼料》、《農產食品科技》5個學術期刊。設有“農友網”、“吉林星火計劃網”、“吉林玉米網”3個網站和“吉林星火計劃網”55個市(州)、縣子網。
近年來，吉林省農業科學院綜合科研實力不斷增強，在多個學科領域形成優勢。現有國家現代農業產業技術體系崗位科學家13人、綜合試驗站站長6人。大豆雜種優勢利用研究達到國際領先水平，培育出世界個大豆雜交種“雜交豆1號”；規模化植物轉基因技術達到國際先進水平，主要農作物種質資源和新品種選育居水平。
“十五”以來，吉林省農業科學院共取得鑒定驗收成果246項。獲得授權發明專利14項，實用新型專利15項，發布標準20項。通過審（認）定動植物新品種269個。獲得成果獎勵117項。其中，國家技術發明二等獎1項，國家科技進步二等獎4項；省、部級科技獎勵一等獎21項，二等獎38項。在“十五”全國1077個農業科研機構綜合科研能力評估中，有6個研究所進入百強。
吉林省農業科學院廣泛開展對外科技交流與合作，與美、英、俄、日、韓、西班牙、波蘭、烏克蘭等8個國家的科研機構、大學和企業建立了良好科技合作關系。
面向未來，吉林省農業科學院將秉持“團結、奉獻、求實、創新”精神，以科學發展觀為指導，加速科技創新，竭誠為“三農”服務，為吉林省乃至東北地區現代農業和農村經濟發展做出新的貢獻。