谷子是農(nóng)作物研究的主要模式作物之一,開展谷子農(nóng)藝性狀基因定位研究,是解析谷子農(nóng)藝性狀分子遺傳機理的關(guān)鍵步驟之一,其研究成果對于其它農(nóng)作物相關(guān)研究也具有重要借鑒意義。
谷子所谷子分子育種團隊利用F2群體,采用RAD-Seq測序技術(shù)構(gòu)建了一張包含9,968個SNP標記總長為1648.8 cM的遺傳圖譜,并定位了與谷子8個農(nóng)藝性狀相關(guān)的QTL位點11個,其中9個為新位點。進一步利用SNP開發(fā)了5個與第二節(jié)間長、主穗長和主穗粗等性狀緊密連鎖的分子標記。該部分結(jié)果于2017年6月23日在線發(fā)表在國際SCI雜志《PLoS ONE》(2016 IF=2.806,12(6):e0179717)。團隊王軍博士為通訊作者。
該團隊與華大合作,利用F2群體,采用RAD-Seq測序技術(shù)完成了一張包含1,694個Bin標記總長為1542.87 cM的遺傳圖譜,定位了一個與谷子米色相關(guān)的基因(Sihc1),該位點可解釋80.26%表型變異。進一步通過生物信息學(xué)方法和基因克隆手段,預(yù)測到4個重要候選基因。該部分結(jié)果于2017年9月22日在線發(fā)表在國際SCI雜志《Mol Breeding》(2016 IF= 2.47,DOI: 10.1007/s11032-017-0727-4)。團隊王軍博士為通訊作者、華大鄒洪鋒博士為共同通訊作者。
上述研究得到了山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院自主創(chuàng)新能力提升工程項目(2015ZZCX-09, 2016ZZCX-09,2017ZZCX-09),山西省青年基金面上項目(201601D202083,2015021143),山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新研究項目(ZDSYS1504),深圳市基礎(chǔ)研究政府資助項目(JCY20150831201123287)和國家谷子現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CRRS-07)等項目資助。
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