如果絲瓜施肥不及時，易發生脫肥現象，造成雌花黃萎、脫落，正在生長發育的果實會發育畸形，影響產量和品質。
實際栽培中，每收獲1～2次絲瓜，就必須追一次肥，每次可迫肥硫酸銨0.5克/千克土或尿素05克/千克土，也可施入氯磷鉀復合肥料0.5克/千克土。施肥時埋入土中（復合肥必須埋入土壤中），在離植株根約12厘米處挖約10厘米深的穴，埋入肥料，施肥后應進行澆水。絲瓜還可結合打藥等進行葉面施肥，如噴施0.4%的尿素溶液等。
絲瓜雖然較耐貧脊，但在肥水充足的條件下，生長健壯，根深葉茂，花果多，瓜條粗直。所以栽培絲瓜除施足基肥外，在定植時澆定根水時可少量施肥，以促進緩苗生長。以后澆水時均可進行追肥。絲瓜對高濃度的肥料也能忍受，肥料充足時也不易發生徒長。絲瓜的整個栽培過程中，其追肥次數和追肥量應比其它瓜類多。