底肥是施肥中基本的一個環節，對作物生長發育尤其是苗期和作物生長前期至關重要，施用底肥一般要從四個方面考慮：即底肥的種類、數量、肥料品種及施用的深度。
從種類上看，有機肥（包括農家肥、廄肥、綠肥和餅肥）適宜作底肥施用，此外氮、磷、鉀和微肥也皆適合作底肥。
要確定底肥施用數量尤其是化肥施用量，必須考慮土壤肥力高低，在有機質低于1.2%的土壤應施用3立方米/畝以上的有機肥。當土壤中氮、磷、鉀及微量元素低于作物施肥有效臨界值時，就應首先選擇底施這些肥料，尤其是作物在前期需要較多的磷肥。
各種肥料作底肥的具體用量可參照當地多年田間肥效試驗結果及目標產量等綜合因素確定，一般高肥力土壤上氮肥總用量的30%左右底施，中、低肥力土壤則有50%-70%的氮肥作為底肥，而磷、鉀肥及微肥盡可能一次全部底施。
從肥料品種上看，氮肥中的碳銨，磷肥中的普鈣、二銨、鈣鎂磷肥、三料，鉀肥中氯化鉀、硫酸鉀、草木灰，微肥中的鋅肥、錳肥等，都適宜作底肥。
從深度方面講，一般底肥應施到整個耕層之內，即15-20厘米的深度。對于有機肥、氮肥、鉀肥、微肥，可以混合后均勻地撒在地表，隨即耕翻入土，做到肥料與全耕層土壤均勻混合，以利于作物不同根系層對養分的吸收利用。磷肥由于移動性差，且施入土壤后易被固定而失去有效性，故在底施時應分上下兩層施用，即下層施至15-20厘米的深度，上層施至5厘米左右的深度。上層主要滿足作物苗期對磷的需求，下層供應作物生長中、后期的磷素營養。