冬小麥腥黑穗病又稱為黑麥、黑疸。冬小麥腥黑穗病的病癥主要出現在穗部，據了解，一般病株較矮，病穗較短且直，開始時為灰綠色，逐漸呈現成灰黃色。冬小麥腥黑穗病對小麥的產量影響極大，帶有病菌的種子會在翌年引起小麥發病，造成小麥減產20-30%，重者小麥減產50%左右。
防治冬小麥腥黑穗病采取有效的方法，加強小麥的栽培管理，適期播種小麥，促進小麥幼苗能夠及早出土，有效的減少小麥的病菌感染；在小麥發病區域進行深耕翻土，并施用腐熟的農家肥；冬小麥的種子必須經過拌種才能播種，在拌種中用2%立克秀拌種劑10-15g，加入少量水調成糊狀液體與10kg麥種混勻，晾干后進行播種，也可用種子重量0.15%-0.2%的20%三唑酮、粉銹寧或0.1%-0.15%的15%三唑、醇百坦、羥銹寧、0.2%的40%福美雙、0.2%的40%拌種雙、0.2%的50%多菌靈、0.2%的70%甲基硫菌靈、甲基硫菌靈、0.2%-0.3%的20%萎銹靈等進行藥劑拌種和悶種，都有較好的防治效果。
冬小麥腥黑穗病病田的土壤處理。對于進行連作的麥田進行土壤殺毒，每畝施用70%甲基硫菌靈可濕性粉劑或50%多菌靈可濕性粉劑1-1.5千克，拌細土45-50千克，均勻的灑在小麥的土壤面，之后進行深耕翻土，有效的防治冬小麥腥黑穗病的蔓延和散播。