病毒病在植株體內有潛隱性，也就是說并不是沒有表現出病毒病的癥狀就沒有感染病毒病，而表現出病毒病癥狀的植株不僅植株體內潛藏著病毒，而且環境條件適合其發生。
種子帶毒和昆蟲傳毒是病毒病發生傳播的二大主要途徑。目前，針對甜椒種子多為進口包衣種子，不便于使用磷酸三鈉處理的情況，提高秧苗的抗病能力和避免昆蟲傳播病毒是預防病毒病的重要環節。
特別是夏秋高溫季節育苗，蚜蟲、粉虱、葉蟬等害蟲嚴重，而這些帶刺吸式口器的害蟲就是傳播病毒病的主要害蟲，因此一定要注意做好防治。
首先要設置防蟲網，阻擋害蟲潛入，其次在發現有害蟲為害時及時用藥進行防治？捎眠料x啉、啶蟲脒等藥劑噴霧防治。同時，在噴藥時還要配合噴施寧南霉素、菇類蛋白等預防病毒病的藥劑。
培育壯苗，提高植株的抗病能力也是預防病毒病的重要措施。因而，在育苗期，一定要合理控制溫、濕度，避免秧苗徒長，同時這也是促進花芽分化，提高甜椒產量的關鍵措施。
高溫干燥是病毒病發生的環境條件。因而，苗期的溫濕度控制也非常關鍵。從片真葉生出到定植，可將白天溫度控制在25-28℃，嚴禁苗床達35℃以上的高溫；夜間溫度控制在15-18℃。若采用工廠化育苗的秧苗，定植時還應將秧苗置于棚中適應1-2天。育苗期間，苗土應保持見干見濕的狀態即可，不宜過干過濕。過干則容易給病毒病病的發生提供有利環境，過濕則植株容易徒長，也容易造成病害的發生。
防治傳毒害蟲，避免高溫干燥的環境，也是甜椒生長期內預防病毒病的重要工作。病毒病發生后，一要注意在寧南霉素或菇類蛋白等防治病毒病的藥劑中加入含鋅的葉面肥和促進植株生長的調節劑？捎脤幠厦顾300倍混加樂得葉面肥500倍再混加600倍的云大120。二要注意掌握在初發病時用藥，且要縮短用藥時間，改原先的7-10天一遍藥為5天左右噴治一次。三要及時采摘，減小損失。同時，及時采摘果實，有利于營養生長的進行，利于植株抗病能力的提高。