微量元素包括硼、鋅、鉬、鐵、錳和銅等營養元素，雖然植物對微量元素的需要量很少，但它們對植物生長發育的作用和大量元素一樣重要。當某種微量元素缺乏時，植物生長發育會受到明顯的影響，產量降低，品質下降。反之，微量元素過多會使作物中毒，影響產量和品質。為提高肥效，減少傷害，施用微肥時應注意以下事項。
1、根據土壤中微量元素的豐缺狀況，采取缺什么補什么，不可盲目施用和過量施用。作物需要微量元素的數量很少，許多微量元素從缺乏到適量的濃度范圍很窄，因此，施用微量元素肥料要嚴格控制用量，防止濃度過大。
2、根據土壤的酸堿度施用。土壤PH過高時，會降低土壤中鋅、鐵、硼、錳、銅等元素的有效性；而在酸性土壤常會引起作物缺鉬。所以應根據土壤的酸堿度，有針對性的施用微肥。
3、根據作物對微量元素的反應選擇施用。各種作物對不同的微量元素有不同的反應，敏感程度不同，需要量也不同，要針對不同作物對不同微量元素的敏感程度，合理選擇和施用。
4、根據天氣狀況補充相應的微量元素。溫度和雨量會影響土壤中微量元素的釋放和作物對它們的吸收，要根據天氣狀況補充相應的微量元素。
5、注意與大量元素、有機肥料配合施用。只有在滿足了作物對大量元素氮、磷、鉀等需要的前提下，微量元素肥料才能表現出明顯的增產效果。有機肥料含有多種微量元素，可調節土壤環境條件，達到提高微量元素有效性的目的。